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    電子芯片奮力“轉(zhuǎn)正”,生物芯片能否自力更生?

       日期:2019-05-22     瀏覽:178    
    核心提示:發(fā)布日期:2019-05-22   前言:   去年,中興被美國開罰單禁止購買核心零件的教訓(xùn)仍

    發(fā)布日期:2019-05-22

      前言:

      去年,中興被美國開罰單禁止購買核心零件的教訓(xùn)仍然歷歷在目;近日,華為備胎“芯片”轉(zhuǎn)正的新聞又刷爆了朋友圈。芯片之殤讓國人痛定思痛,一定要掌握核心科技,自力更生。談起電子芯片讓人難免聯(lián)想到體外診斷IVD領(lǐng)域的“生物芯片”技術(shù)。我國的生物芯片行業(yè)在1997-1998年開始蓬勃發(fā)展,盡管目前的市場份額和核心技術(shù)仍主要由外資企業(yè)壟斷,但國內(nèi)已經(jīng)有多家公司開始奮力追趕。

      一、生物芯片是生物材料的集成

      生物芯片借鑒計算機平行分析的思想,對海量的生物信號進行平行分析。被動式生物芯片,又稱微陣列芯片,通過微加工技術(shù)和微電子技術(shù),將成千上萬個生物信息密碼集中到一小片固相基質(zhì)上,以實現(xiàn)對細胞、蛋白質(zhì)、DNA以及其他生物組分的準(zhǔn)確、快速、高通量的檢測。主動式生物芯片把生物實驗中的樣本處理純化、反應(yīng)標(biāo)記及檢測等多個實驗步驟集成,通過一步反應(yīng)就可主動完成。 其特點是快速、操作簡單,因此有人又將它稱為功能生物芯片 。主要包括微流控芯片(microfluidic chip)和芯片實驗室(lab on chip)。專家預(yù)測芯片實驗室會是生物芯片的主流發(fā)展方向。這些年來,片上系統(tǒng)的相關(guān)技術(shù)已經(jīng)逐漸成熟。今后幾年,多款芯片實驗室產(chǎn)品將會上市。

      生物芯片的基質(zhì)材料有尼龍膜、玻璃片、塑料、硅膠晶片、微型磁珠等;而根據(jù)所檢測的生物信號分類,分為核酸芯片、蛋白質(zhì)芯片、細胞芯片甚至組織碎片芯片等;按工作原理分,有雜交型、合成型、連接型、親和識別型等。

      生物芯片有高通量性(可同時分析成千上萬種分子)、微型化(所需試劑用量?。⒏叨茸詣踊?、適用于多指標(biāo)檢測等優(yōu)點,但也會受到在同一溫度下雜交,不同探針雜交效率不同等因素的制約。

      二、基因芯片

      基因芯片利用大規(guī)模集成電路的手段控制固相合成的成千上萬個寡核昔酸探針,并把它們密集、規(guī)律地排列在1cm見方大小的硅片或玻璃晶片上,其容量可達20—40萬個基因探針。然后將熒光標(biāo)記的DNA或cDNA樣品在芯片上與探針雜交,經(jīng)激光共聚焦顯微鏡掃描,以計算機系統(tǒng)對熒光信號作出比較和檢測??蒲猩?,主要應(yīng)用于發(fā)現(xiàn)新的功能基因,基因表達分析﹑DNA序列測定和比較﹑突變體和多態(tài)性的檢測等方面。

      在臨床上,基因芯片技術(shù)已經(jīng)成熟應(yīng)用于產(chǎn)前染色體微陣列分析(CMA),胚胎植入前染色體異常(PGS)等方面,罕見遺傳病診斷,耳聾基因突變位點檢測,呼吸道病原體檢測與分型等多個方面。

      現(xiàn)在全世界已有十多家公司專門從事基因芯片的研究和開發(fā)工作,且已有較為成型的產(chǎn)品和設(shè)備問世。基因芯片的市場由于較高的技術(shù)門檻、研發(fā)投入要求高、昂貴的使用成本等原因,整體呈現(xiàn)寡頭壟斷的格局。

      2007年,Roche以2.725億美元收購了NimbleGen公司,總銷售額位居第四。NimbleGen成立于1999年,主要研發(fā)基因組分析所用的高密度芯片,這家位于麥迪遜的生物技術(shù)公司,在全球芯片市場上排名第4。但是Roche于2018年宣布,它將在未來兩年內(nèi)關(guān)閉位于麥迪遜的測序方案工廠(前身為NimbleGen)。這可能與其2012年宣布退出固相DNA芯片市場,專注于測序以及測序上游的序列捕獲技術(shù)的市場戰(zhàn)略相關(guān)。

      1999年成立的Illumina業(yè)務(wù)起家主要是銷售微陣列芯片(microarray chip),這種芯片可用來檢測基因組上特定部位的重要變化。2007年,Illumina宣布以6億美元收購基因測序公司Solexa,從而進軍基因測序市場,開始實現(xiàn)差異化的跨越式發(fā)展。主營方向改為基因測序,其2013﹑2014﹑2015的基因芯片業(yè)務(wù)占比持續(xù)下滑,分別為27%﹑19%和14%,營業(yè)額分別為3.8億美元﹑3.5億美元和3.1億美元。

      美國 Affymetrix 公司目前是基因芯片行業(yè)的領(lǐng)頭羊(2016年被賽默飛以13億美元收購),1992-Stephen P.A. Fodor博士在硅谷成立Affymetrix公司,1994-商業(yè)化運營GeneChip,推出了第一張商業(yè)化基因芯片,并且注冊了商標(biāo)。Affymetrix的專利是光引導(dǎo)原位寡聚核苷酸合成技術(shù)。年產(chǎn)寡聚核苷酸基因芯片達幾十萬張,占據(jù)表達譜基因科研市場的一半以上。

      PerkinElmer于2010年斥資9000萬美元收購芯片制造商Signature Genomics。Signature Genomics是一家率先采用染色體微陣列技術(shù)做產(chǎn)前和產(chǎn)后細胞遺傳學(xué)檢測的公司。目前核心產(chǎn)品CGX Oligo整合了芯片雜交系統(tǒng)、芯片掃描儀ScanRI及數(shù)據(jù)可視化軟件Genoglyphix®等,組成了染色體微整列分析完整的生態(tài)系統(tǒng)。另外值得一提的是,PE旗下的Packard公司開發(fā)出第一臺商業(yè)化芯片Scan Array 3000,并擁有多項技術(shù)專利,使得PE成為芯片掃描儀市場的領(lǐng)導(dǎo)者,全球市場份額躍居第一。

      安捷倫是生命科學(xué)、診斷和應(yīng)用化學(xué)市場領(lǐng)域的領(lǐng)導(dǎo)者。安捷倫擁有專利的基因芯片的制造工藝—噴墨打印化學(xué)原位合成技術(shù)。產(chǎn)品包括:全基因組表達譜芯片、小RNA芯片、Human CGH+SNP 芯片、基因芯片微陣列掃描儀等。2015年1月27日,Agilent宣布,NMPA已批準(zhǔn)公司的SureScan Dx微陣列芯片掃描儀作為體外診斷的醫(yī)療器械應(yīng)用。專家認為把微陣列掃描技術(shù)帶入到臨床質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)是將全基因組染色體分析的優(yōu)勢推廣到臨床領(lǐng)域的一個重要里程碑。

      三、蛋白質(zhì)芯片和微流控芯片

      蛋白質(zhì)芯片又稱蛋白質(zhì)微陣列,可用于蛋白質(zhì)功能研究與相互作用分析。蛋白質(zhì)芯片采用原位合成,機械點樣或共價結(jié)合的方式將酶、抗原、抗體、受體、配體、細胞因子等固定于玻片、硅、云母及各種膜片形成的生物分子集陣。

      不得不提的液相芯片技術(shù)是20世紀90年代后期發(fā)展起來的被喻為后基因組時代的芯片技術(shù),由美國納斯達克上市公司Luminex研制開發(fā),國際上又被稱為XMAP(flexible Multilyte Profiling)技術(shù)。核心專利是乳膠微球包被﹑熒光編碼以及微球分子雜交。其反應(yīng)快速,靈敏度極高,微球上固定的探針與待測樣品在溶液中反應(yīng),碰撞速率是固相芯片或Elisa的10倍以上,并且采用96孔板為反應(yīng)容器,通量大。

      到2005年全球獲得FDA認證的液相芯片項目已近200個。其全球最達的檢測平臺為美國Luminex公司和荷蘭的QIAGEN跨國公司。而在美國Luminex公司生產(chǎn)的Luminex檢測系統(tǒng)上,目前已有國內(nèi)生產(chǎn)的商品化試劑供應(yīng):比如上海透景公司生產(chǎn)的腫瘤標(biāo)志物18項檢測產(chǎn)品、HPV檢測產(chǎn)品和Torch檢測產(chǎn)品等。另外研發(fā)可根據(jù)研究需要自行制備探針微球交聯(lián)微球,建立反應(yīng)體系對各種標(biāo)本進行檢測,如細胞因子IL-2、IFN-r、IL-4水平檢測和抗核抗體檢測等。

      微流控芯片實驗室技術(shù)的核心在于精確控制在微升和納升級反應(yīng)空間中流動的液體,來完成一系列的反應(yīng),分離和檢測。目前一些商業(yè)公司如Agilent﹑Caliper為微流控分析儀開發(fā)了系列試劑盒,目前只針對毛細管電泳功能,還未達到真正的集成化。1999年惠普(現(xiàn)Agilent)與Caliper合作,首臺微流控芯片商品化儀器Bioanalyzer 2100開始在歐美市場銷售,累計銷售超萬臺。Caliper的旗艦產(chǎn)品為LabChip 3000新藥研發(fā)系統(tǒng),主要應(yīng)用是高通量藥物篩選。據(jù)Caliper稱,其占據(jù)了75%的全球市場份額。

      國內(nèi)在微流控研發(fā)方面,涉及到很多的公司,包括博奧生物的呼吸道感染病原體微流控芯片、博暉創(chuàng)新的HPV基因分型檢測微流控芯片,萬孚生物參股英國的Atlas Genetics。小型化的微流控儀器有理邦儀器的M16磁敏免疫分析儀,華邁興微的M2微型化學(xué)發(fā)光分析儀。其中,博奧生物的呼吸道病原體檢測系統(tǒng)已取得不俗佳績,在全國31個省區(qū)市的200多家醫(yī)院投入使用,有些醫(yī)院的月檢測量已達600多份。博暉創(chuàng)新的24種基因型HPV病毒于2016年6月得到NMPA注冊證。

      結(jié)語:

      總體而言,在研究方面,我國生物芯片的綜合學(xué)術(shù)水平與國際水平差距正在逐漸縮小,但在芯片各關(guān)鍵技術(shù)如輸運和標(biāo)記整合技術(shù)、新型生物芯片設(shè)計理論體系、集成化檢測技術(shù)等方面的基礎(chǔ)研究水平仍有待提高。在產(chǎn)業(yè)化方面,我國生物芯片的產(chǎn)業(yè)發(fā)展在面臨著巨大挑戰(zhàn)的同時,正面臨著良好的機遇。生物芯片技術(shù)正逐步走向整體化、系統(tǒng)化,相應(yīng)的配套試劑、儀器和軟件的研究越來越受到重視。我們期待我國生物芯片技術(shù)將在不遠的將來與世界同行同臺競爭,為國民生活質(zhì)量的提高,為人類的科技的發(fā)展做出應(yīng)有的貢獻。

    來源:思宇醫(yī)械觀察

     
     
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