發(fā)布日期:2019-02-01
1月15日,德國馬普所科研人員在PNAS上發(fā)表了題為“HIV peptidome-wide association study reveals patient-specific epitope repertoires associated with HIV control”的文章,通過HIV多肽組關(guān)聯(lián)分析揭示了與HIV控制相關(guān)的患者特異性抗原表位序列,為HIV的精準(zhǔn)治療提供了新靶點(diǎn)。
高度多態(tài)性HLA I類分子抗原肽結(jié)合溝槽的遺傳變異與HIV-1控制和向艾滋病的進(jìn)展有關(guān)聯(lián),此類變異占到HIV-1調(diào)定點(diǎn)病毒載量(set point viral load, spVL)變異的12%。這表明HLA將HIV-1抗原表位遞呈給T細(xì)胞在疾病控制中起著重要作用,但是HIV抗原表位與相應(yīng)HLA的結(jié)合機(jī)制不是十分明確。在本研究中,科研人員開發(fā)了一種多肽組關(guān)聯(lián)分析(peptidome-wide association study, PepWAS)方法,整合了6311名HIV感染患者的HLA基因型和spVL數(shù)據(jù),以篩選整個(gè)HIV-1蛋白質(zhì)組(3252個(gè)特異肽)中與疾病相關(guān)的肽。通過PepWAS法,預(yù)測了與spVL相關(guān)的一組核心抗原表位,包括已知的抗原表位以及幾個(gè)先前未明確的疾病相關(guān)肽。更重要的是,每個(gè)患者通過各自的HLA-A和HLA-B變異體僅呈現(xiàn)出這些預(yù)測的核心表位的一小部分。這些患者特異的抗原表位的個(gè)體差異導(dǎo)致了spVL的變化。PepWAS法的應(yīng)用全面揭示了HLA和HIV-1控制之間的緊密聯(lián)系,為AIDS靶向治療提供了可優(yōu)先考慮的抗原表位。(摘譯自PNAS, Published: 15 January 2019)
來源:科技部