發(fā)布日期:2018-12-10
近日,哈佛大學(xué)華人科學(xué)家(中國科學(xué)院外籍院士)莊小威教授團隊在國際頂尖雜志Science上在線發(fā)表了題為“Super-Resolution Chromatin Tracing Reveals Domains and Cooperative Interactions in Single Cells”的研究論文,采用超分辨率染色質(zhì)示蹤的方法揭示了單細胞染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)域和相互協(xié)同作用。
人類基因組中約30億個DNA堿基對,包含2萬多個基因,并擁有上百萬個調(diào)控元件;其細胞核的大小雖僅為10-20微米,但其DNA長度卻高達2米。學(xué)界普遍認為,染色體空間構(gòu)象的高度折疊以及動態(tài)變化在基因的表達和調(diào)控方面發(fā)揮了積極的作用。但傳統(tǒng)的高通量測序和scHi-C(single cell Hi-C)等方法多是基于群體細胞水平的平均(population average)分析,目前還不能在單細胞層面解析拓撲相關(guān)結(jié)構(gòu)域(topologically associating domains,TADs)和染色質(zhì)環(huán)(loops)等;該研究采用MERFISH超高分辨成像技術(shù)在單細胞層面直接證明了真實存在類TAD結(jié)構(gòu)域的物理性結(jié)構(gòu)(physicalstructure),同時該結(jié)構(gòu)域的邊界(boundaries)在不同的細胞中具有高度的異質(zhì)性特點;為進一步明確同一基因在不同細胞中的特異時空表達機制提供了新的契機。
來源:科技部