作者：魯亦發(fā)布日期：2018-09-17
《自然》近日在線發(fā)表的一篇論文對(duì)數(shù)千種BRCA1的基因變異按功能進(jìn)行了更精確的分類(lèi)。這些功能評(píng)分對(duì)乳腺癌和卵巢癌罹患風(fēng)險(xiǎn)的基因檢測(cè)解讀或具有臨床意義。
BRCA1是一種人體腫瘤抑制基因，BRCA1失去功能的突變與易患早發(fā)型乳腺癌和卵巢癌有關(guān)。雖然已發(fā)現(xiàn)的BRCA1基因變異有數(shù)千種，但許多都被列為“意義未明的變異”，給患癌風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估帶來(lái)了巨大挑戰(zhàn)。
要弄清這些意義未明的變異，其中一個(gè)方法是檢測(cè)變異基因的表達(dá)是否具有恢復(fù)DNA修復(fù)的功能，這也是腫瘤抑制過(guò)程的一部分。美國(guó)華盛頓大學(xué)的Jay Shendure及同事運(yùn)用基因組編輯技術(shù)，對(duì)BRCA1基因功能至關(guān)重要的13個(gè)外顯子上的近4000種單核苷酸變異（SNV）的功能進(jìn)行了評(píng)估，并在2000萬(wàn)個(gè)人類(lèi)單倍體（HAP1）細(xì)胞中進(jìn)行了后續(xù)細(xì)胞存活率測(cè)定。
最后，研究人員識(shí)別出了約300種會(huì)干擾表達(dá)的SNV以及400多種錯(cuò)義突變的SNV（會(huì)導(dǎo)致蛋白質(zhì)的氨基酸序列改變），發(fā)現(xiàn)這些變異并無(wú)實(shí)際功能（不破壞基因的原有功能）。這些功能評(píng)分與已知的致病性變異或良性變異的臨床評(píng)估密切相關(guān)。
該團(tuán)隊(duì)指出，與其他細(xì)胞系相比，HAP1細(xì)胞系可能不是生理學(xué)上的最優(yōu)模型，但與臨床評(píng)估的高度相關(guān)性驗(yàn)證了數(shù)據(jù)。研究者肯定了功能評(píng)分對(duì)變異分類(lèi)的重要價(jià)值，并認(rèn)為研究結(jié)果可直接應(yīng)用于BRCA1基因篩查的解讀。（魯亦）
相關(guān)論文信息：DOI：10.1038/s41586-018-0461-z
《中國(guó)科學(xué)報(bào)》 (2018-09-17 第2版 國(guó)際)
來(lái)源：中國(guó)科學(xué)報(bào)
