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    這家臺灣醫(yī)院并沒有教 AI 診斷特殊肝癌病例,但機器自己卻成功發(fā)現(xiàn)了

       日期:2017-12-09     瀏覽:73    
    核心提示:發(fā)布日期:2017-12-08 人們常常說,神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)像是一個黑盒子。之所以這么講,是因為相比一些

    發(fā)布日期:2017-12-08

    人們常常說,神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)像是一個黑盒子。之所以這么講,是因為相比一些基于規(guī)則的系統(tǒng),神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)或其他機器學(xué)習(xí)算法并不透明,目前你并不知道它是怎么運作、下判斷的。但也因為無法掌握,偶爾就有意料之外的發(fā)現(xiàn),有一家醫(yī)院的AI研究中心就經(jīng)歷了這種驚喜。

    位于臺灣的“中國醫(yī)藥大學(xué)”附設(shè)醫(yī)院(CMUH)的人工智能醫(yī)學(xué)診斷中心,正在訓(xùn)練機器看計算機斷層掃描(CT)影像來診斷肝癌,令人意外的是,研究人員在訓(xùn)練初期還沒有把一些發(fā)生機率很低的特殊病例素材放進(jìn)機器的訓(xùn)練數(shù)據(jù)集中,沒想到, AI 卻自己發(fā)現(xiàn)了,“機器自動找到 nodule in nodule ,也就是腫塊之中還有一個變異腫塊,”CMUH人工智能醫(yī)學(xué)診斷中心副主任游家鑫興奮地說。

    AI+醫(yī)學(xué)影像的研究及應(yīng)用遍地開花

    在現(xiàn)階段的醫(yī)療保?。╤ealthcare)AI領(lǐng)域中,圖像及診斷輔助可說是最受歡迎的應(yīng)用,不久前剛落幕的北美放射學(xué)會(RSNA)2017 年會上,機器學(xué)習(xí)就成了核心話題, RSNA 首度舉辦一場機器學(xué)習(xí)挑戰(zhàn)賽:利用兒童手部的X光片,讓機器自動判斷骨骼年齡。希望通過眾人的腦力激蕩,開發(fā)出更精準(zhǔn)的算法來解決放射學(xué)(radiology)遇到的臨床問題。

    另外,大型企業(yè)如 IBM 、 Google 、醫(yī)療設(shè)備商如 GE 、飛利浦、西門子以及眾多的初創(chuàng)公司,也紛紛攜手醫(yī)院、醫(yī)療機構(gòu)展開諸多研究,而且獲得了不錯的效果。像是 Google Research 研究人員利用卷積神經(jīng)網(wǎng)路(CNN)讀取糖尿病患者的眼部照片,判斷是否有視網(wǎng)膜病變(diabetic retinopathy),目前試驗結(jié)果顯示,演算法判斷結(jié)果與專業(yè)眼科醫(yī)生的診斷結(jié)果呈高度一致性。

    另一家在醫(yī)療視覺分析領(lǐng)域具高知名度的以色列初創(chuàng)公司Zebra Medical Vision,他們也利用深度學(xué)習(xí)解讀計算機斷層掃描、核磁共振成像等醫(yī)學(xué)影像,可識別出肺臟、肝臟、心血管或骨頭中的疾病,還特別強調(diào)每一張影像的判讀費用只需要1美元!

    調(diào)研機構(gòu) IDC 指出, 2017 年的人工智能/認(rèn)知計算的應(yīng)用中,支出最多的除了自動化顧客服務(wù)(15億美元)之外,就是診斷和治療系統(tǒng)(11億美元)。 IDC 醫(yī)療領(lǐng)域亞太區(qū)研究經(jīng)理 Ashwin Moduga 認(rèn)為,醫(yī)院使用 AI/Cognitive 技術(shù)例如以深度學(xué)習(xí)改進(jìn)醫(yī)學(xué)圖像診斷,不僅僅是為實現(xiàn)自動化或提高精確度,更重要的是解決某些地區(qū)醫(yī)療專家、資源匱乏的問題,在未來2~3年內(nèi),醫(yī)院將陸續(xù)展開一些簡單的自動化測試,同時投資深度學(xué)習(xí)算法。

    確實,醫(yī)療產(chǎn)業(yè)對 AI 表現(xiàn)出高度興趣, CMUH 人工智能醫(yī)學(xué)診斷中心就是一例。在 DT 君采訪當(dāng)日,研究人員正在跟中心主任黃宗祺進(jìn)行越洋電話會議,匯報每日的工作進(jìn)度,因為黃宗祺具備電機、醫(yī)療影像、放射跨領(lǐng)域的優(yōu)勢,因此獲得 NVIDIA 邀請,正在美國總部展開為期一年關(guān)于細(xì)胞影像及乳癌方面的交流及進(jìn)修。

    “AI是這個時代影響層面最大的工具,一定會改變醫(yī)療生態(tài)。在所有數(shù)據(jù)中,醫(yī)療數(shù)據(jù)無疑是最有意義的,兩者會結(jié)合的非???,Google、阿里巴巴、蘋果....世界上每一家AI技術(shù)領(lǐng)先的公司都在進(jìn)入醫(yī)療行業(yè).......” ,黃宗祺強調(diào)。

    圖|CMUH人工智能醫(yī)學(xué)診斷中心主任黃宗祺。(圖片來源:CMUH人工智能醫(yī)學(xué)診斷中心)

    放射科醫(yī)生每天都有看不完的片子........

    什么是醫(yī)學(xué)影像呢?就是幫助醫(yī)生不需動刀就能觀測病患身體內(nèi)部狀況的技術(shù),包括我們常聽說的超聲波、 X 光片,還有計算機斷層掃描(CT)、核磁共振成像(MRI)、正電子放射斷層造影術(shù)(PET,Positron Emission Tomography)、單光子發(fā)射型計算機斷層(SPECT,Single Photon Emission Computer Tomography),每一種方式都有其優(yōu)勢,適合用來檢查不同的病癥,像是超聲波可快速掃瞄,方便性高, CT 、MRI 則是善于做結(jié)構(gòu)、組織異常的偵測,SPECT則適合偵測神經(jīng)傳導(dǎo)物質(zhì)、代謝的異常。

    再簡單看一下醫(yī)院的工作流程:當(dāng)我們可能感覺到身體不適時,到醫(yī)院掛號后,就會有一個“??漆t(yī)生”如肝膽腸胃科科、乳房外科等,聽取我們描述病征,接著他會安排檢查,例如CT、MRI等,有一群在背后檢查這些醫(yī)學(xué)影像的人就是“放射科醫(yī)生”,他們的工作就是看一張又一張的片子、打出報告,提供給??漆t(yī)生去擬定治療方案。

    為什么把 AI 應(yīng)用在醫(yī)學(xué)影像領(lǐng)域會有如此急迫的需求?因為放射科醫(yī)生的人力非常有限,而且他們每一天花費很多的時間看大量的片子。

    放射科醫(yī)生的工作負(fù)擔(dān)是遠(yuǎn)超過你想像的大,因為腫瘤的位置不一定只會出現(xiàn)在身體某個部位,因此一個病人至少會拍上百張的圖像,他們就必須一張一張看,再從中挑出數(shù)十張可用的圖像數(shù)據(jù),“所以每一個醫(yī)生都很累,工作到眼睛很痛,”本身擁有放射師執(zhí)照的 CMUH 人工智能醫(yī)學(xué)診斷中心數(shù)據(jù)工程師林仰賢這么說。

    所以如果能夠通過 AI 來協(xié)助醫(yī)生加快看片的速度,就有更多的病患能從中受惠,不論是快速找到治療方法還是預(yù)防其他病癥的產(chǎn)生。

    像是上述提及 Google Research 的研究,糖尿病患者因長期血糖上升,導(dǎo)致血小板凝集力上升,毛細(xì)血管受損,容易引起眼部視網(wǎng)膜毛細(xì)血管病變,嚴(yán)重會導(dǎo)致視力喪失,早期診斷治療是保住病人視力最重要的依據(jù)??上У氖?,部分醫(yī)療資源稀缺的地區(qū)如印度,就有眾多的患者因為醫(yī)院得排隊排很久、看不到醫(yī)生而失明,比例高達(dá)近45%。但其實如果擁有足夠的醫(yī)療人力資源的話,這些失明都是完全可以預(yù)防及避免的。

    而人工智能很有機會改變現(xiàn)今醫(yī)護(hù)供給、需求高度落差的狀況,協(xié)助提升醫(yī)療行業(yè)效率。

    CMUH人工智能醫(yī)學(xué)診斷中心的研究有兩大部分,初期是做放射組學(xué)(Radiomics),林仰賢解釋,Radiomics 是一種結(jié)合多種演算法的影像處理技術(shù),從醫(yī)學(xué)影像如 CT、MRI 定量病變(lesion)的特征,再將特征與事件做連接,建立出模型。簡單來說,就是計算圖像的特征值,從這些數(shù)值中去判別某個疾病跟某個事件的關(guān)聯(lián)性。

    他們使用肝臟的 CT 影像,分析這位病人在 2~3 年之內(nèi)會不會出現(xiàn)腫瘤轉(zhuǎn)移,或是治療后復(fù)發(fā)的可能性。過去,一直以來都是憑醫(yī)生自己的經(jīng)驗、“感覺”來判斷,沒有一種可量化的方式,但因為憑經(jīng)驗判斷,不同的醫(yī)生來看就可能給出不同的答案,而判斷不同,后續(xù)就會展開不同的療法,最極端的狀況就是一個說有病,另一個說沒病。因此他們希望通過Radiomics 讓影像有標(biāo)準(zhǔn)化。

    圖|放射組學(xué)(Radiomics)研究的流程。(圖片來源:CMUH人工智能醫(yī)學(xué)診斷中心)

    CMUH人工智能醫(yī)學(xué)診斷中心因為隸屬于醫(yī)院,做 AI 研究的好處就是較容易取得數(shù)據(jù),同時又有許多醫(yī)生可供咨詢,畢竟 AI 系統(tǒng)的使用者是醫(yī)生,必須重視用戶意見。因此中心的研究人員與院內(nèi)多位醫(yī)生討論下,認(rèn)為現(xiàn)階段較好的 AI 應(yīng)用應(yīng)該是作為醫(yī)生的助手,希望通過 AI 減輕醫(yī)生的工作負(fù)擔(dān),他們就將研究重心從 Radiomics 做轉(zhuǎn)移(metastasis)、復(fù)發(fā)(recurrence)的評估,轉(zhuǎn)為利用深度學(xué)習(xí)做腫瘤檢測(detection)。

    游家鑫表示:“因為醫(yī)生每天花超過10小時看 CT ,手動圈出腫瘤的位子,而且還是用鼠標(biāo)一筆一筆畫,真的很花時間,我們希望先幫醫(yī)生打造一個隨手可用的好工具。”

    AI真的比我們想像的厲害

    他們使用了超過 200 個肝癌病例,每一位病例至少上百張的醫(yī)學(xué)圖像,作為訓(xùn)練數(shù)據(jù),雖然病例數(shù)量還不算多,但目前效果相當(dāng)不錯。

    先用下方的肝臟 CT 圖片來解釋,左邊 Ground Truth 圖是傳統(tǒng)的做法,就是醫(yī)生看片子,把腫瘤的位置、大小框出來。右邊 Detection 圖是 AI 偵測的結(jié)果,上頭顯示 HCC(肝細(xì)胞癌 Hepatocellular Carcinoma,簡稱HCC) 0.977 ,數(shù)字指的是機器下判斷的自信程度(與準(zhǔn)確率無關(guān),只是機器在做判斷時對答案的自我評估)。

    圖|左圖是醫(yī)生手動標(biāo)示,右圖是 AI 偵測的結(jié)果,HCC 0.977 數(shù)字是機器下判斷的自信程度。(圖片來源:CMUH人工智能醫(yī)學(xué)診斷中心)

    圖|左圖是醫(yī)生手動標(biāo)示,右圖是 AI 偵測的結(jié)果,機器都能找出腫瘤位置及大小。(圖片來源:CMUH人工智能醫(yī)學(xué)診斷中心)

     

    不僅 AI 可以找出腫瘤位置、框出邊緣,甚至還出現(xiàn)驚喜,游家鑫指出有兩個很特別的狀況,一個是他們沒有教機器 nodule in nodule 腫瘤中還有一個腫瘤這種低機率低的情況,但它自己找出來了,當(dāng)初研究人員看到機器標(biāo)這張圖,還以為機器出錯,就拿去請教醫(yī)生,才知道原來這就是 nodule in nodule 。另一個就是有一張素材里有一個“人為標(biāo)錯”的狀況,因為有時醫(yī)生真的太疲累而畫錯,但機器卻自己找出正確的腫瘤位置。

    圖|這張圖就是 nodule in nodule ,他們沒有教機器這個狀況,但機器自己發(fā)現(xiàn)了,不過也值得注意的是,對于第二顆腫瘤機器下判斷的自信程度是 HCC 0.8 ,對比一般機器的自信通常都會超過 0.9 來說,它是稍微沒有自信,但還是識別出來了。(圖片來源:CMUH人工智能醫(yī)學(xué)診斷中心)

    除了肝癌之外, CMUH 人工智能醫(yī)學(xué)診斷中心目前也在展開乳癌的AI醫(yī)學(xué)影像識別研究,“主要是鎖定亞洲人較容易罹患的疾病,像是肝癌、肺癌、乳癌,反觀歐美的研究主要是皮膚癌,但亞洲人普遍不愛曬太陽,罹病機率較少,”游家鑫解釋。

    AI真的比我們想像來得厲害嗎?

    從 CMUH 的例子來看,AI 聽起來真的很聰明,還自己學(xué)習(xí)了那些人類沒有教它的事,但 AI 真的有如我們想像的那么厲害嗎?游家鑫坦言,有時候機器還是會找不出來,因為目前他們給的訓(xùn)練數(shù)據(jù)都是比較大的腫瘤,當(dāng)機器遇到很小很小的腫瘤時,有時就識別不出來,也曾經(jīng)發(fā)生過機器識別錯誤的情況。

    也就是說,如果真的要訓(xùn)練一個準(zhǔn)確的 AI ,訓(xùn)練數(shù)據(jù)必須越多元化越好。因此,他們除了計劃與鄰近的醫(yī)院合作,增加病例的數(shù)量,也是為了讓機器看不同設(shè)備品牌如GE、西門子、飛利浦掃描出來的照片,“最好是讓 AI 軟體都看過一次,提高對不同機器的適應(yīng)性。”

    同時,他們下一步計劃把健康人士的圖檔加進(jìn)訓(xùn)練數(shù)據(jù)集里。一般來說,當(dāng)人是健康的時候,醫(yī)院并不會特別在影像上標(biāo)注,例如,在做超聲波時,通常都是當(dāng)醫(yī)生看到了異常,才會按鍵把影像拍下來,正常就不會拍。但由于 CMUH 的放射線部醫(yī)生相當(dāng)支持 AI 研究,不少醫(yī)生愿意額外投入時間幫忙標(biāo)標(biāo)注,或是拍下一般人士健康狀態(tài)的醫(yī)學(xué)影像,協(xié)助中心有更多的精準(zhǔn)數(shù)據(jù)可供訓(xùn)練。唯有讓機器看過更多的病例、不同品牌設(shè)備拍攝的圖像,才能學(xué)得越多。

    圖|CMUH人工智能醫(yī)學(xué)診斷中心副主任游家鑫(左)、人工智能醫(yī)學(xué)診斷中心數(shù)據(jù)工程師廖英凱(中)、人工智能醫(yī)學(xué)診斷中心數(shù)據(jù)工程師林仰賢(右)。(圖片來源:DeepTech深科技)

    AI落地醫(yī)療仰賴醫(yī)生的正確標(biāo)記數(shù)據(jù)

    相比多數(shù)用 AI 做影像識別的應(yīng)用或行業(yè),要在醫(yī)療落地的難度絕對是最困難的,“毫無疑問,機器學(xué)習(xí)將改變放射科醫(yī)師在未來幾年的實踐方式,但在機器學(xué)習(xí)變得普及之前,還有許多工作要做,”斯坦福大學(xué)放射學(xué)及生理醫(yī)療信息系教授 Curtis Langlotz 曾這么說,他口中的工作包括了面臨監(jiān)管問題,機器學(xué)習(xí)還需要大量標(biāo)記的圖像數(shù)據(jù)集,盡管大多數(shù)放射學(xué)已經(jīng)進(jìn)行了數(shù)百萬次的影像檢查,但是大部分都沒有標(biāo)記。

    姑且先撇除算法必須通過嚴(yán)格的臨床實驗及法規(guī),光是在數(shù)據(jù)及訓(xùn)練上至少就有三件事得解決。

    首先,“醫(yī)療領(lǐng)域最大的不同在于對影像下標(biāo)注只能依靠專業(yè)人士,”游家鑫強調(diào)。舉例來說,不論是在安防領(lǐng)域或是自動駕駛領(lǐng)域,一般人都可以為圖像下標(biāo)注,因為常人都可以分辨出這是人、貓狗動物、汽車、信號燈等,但是,在醫(yī)學(xué)影像里,一般人根本看不出身體到底哪里出了異常,例如給你看一張 CT ,無法分辨什么有或沒有癌癥、位置在哪里,更不要說有時腫瘤還非常小,這是只有受過專業(yè)訓(xùn)練的醫(yī)生才擁有判斷的能力。

    不僅 CMUH 提出了這個觀察,負(fù)責(zé)糖尿病視網(wǎng)膜病變計劃的 Google 研究團(tuán)隊產(chǎn)品經(jīng)理、醫(yī)學(xué)博士彭浩怡(Lily Peng)在接受媒體采訪時曾指出, Google 團(tuán)隊建立了一個數(shù)據(jù)集,并聘請 54 名專業(yè)眼科醫(yī)師評估超過 13 萬張的圖像。

    另外,“在醫(yī)療產(chǎn)業(yè),數(shù)據(jù)絕對比算法重要,如果訓(xùn)練數(shù)據(jù)越精確,訓(xùn)練出來的機器也會變得越強,”游家鑫一語道出重點,因此想要訓(xùn)練出好的醫(yī)療人工智能,必須得仰賴專業(yè)醫(yī)生的協(xié)助,替影像數(shù)據(jù)下出精確的標(biāo)簽及診斷,換句話說,就是得靠人類名師的幫忙才能培育出 AI 高徒。

    林仰賢指出另一個比其他行業(yè)更有挑戰(zhàn)的問題,就是影像的色彩,一般行業(yè)訓(xùn)練 AI 都是使用彩色的圖像,例如訓(xùn)練自駕車,一定就得讓機器看過信號燈、交通標(biāo)示的影像,信號燈有紅黃綠、標(biāo)示通常有紅色、黃色,但是醫(yī)療影像都是黑與白,再加上有些醫(yī)療院所用的儀器可能是較舊的機型,拍出來影像的解析度較差,因此要做醫(yī)療影像的識別必須不斷試驗多種算法,找出適合檢視黑白圖像的算法,而且還要夠克服低解析度的問題,在在考驗團(tuán)隊的技術(shù)能力。

    此外,就是數(shù)據(jù)的取得。醫(yī)院內(nèi)部做 AI 研究,數(shù)據(jù)的取得相對容易,但對外部的人來說,想要拿到醫(yī)院的影像數(shù)據(jù)可就不簡單,DT君采訪一家專攻 AI 醫(yī)學(xué)影像識別的新加坡初創(chuàng)公司 adaline ,其創(chuàng)辦人鄭子雙表示,他們目前與新加坡公立醫(yī)院合作,取得了 1000 多位病患的影像數(shù)據(jù),“但完全不夠!所以要一直跟醫(yī)院合作,包括東南亞、香港、臺灣,希望至少得拿到 10 萬個病例。”不過,想要跟各地的醫(yī)院合作就得按各地的法規(guī)來走,對于初創(chuàng)公司來說是一條漫長的路,因此誰取得數(shù)據(jù)越多、速度越快,就有比較高的機會在市場占到位子。

    醫(yī)學(xué)界對于 AI 應(yīng)用,看似有支持及反對兩類聲音,游家鑫強調(diào):“人工智能是絕不可能取代醫(yī)生的,但絕對可以作為一個輔助醫(yī)生的好助理,”檢測早期癌癥或預(yù)防疾病的發(fā)生,同時還有助于減少因“人眼”錯失,或是忽略細(xì)微差異而發(fā)生診斷上的疏漏,這是利用計算機跟 AI 最大的價值,不過得有醫(yī)生的支持,AI 才有可能在醫(yī)學(xué)行業(yè)落地。

    來源:DeepTech深科技

     
     
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