發(fā)布日期：2017-11-03
在本期出版的《Carcinogenesis》中，研究小組報道了三個新的容易使人患病的單核苷酸多態(tài)性（SNPs），其中2個SNPs可提高非小細(xì)胞肺癌（non-small-cell lung cancer，NSCLC），另一個對應(yīng)肺鱗癌風(fēng)險。三個新SNPs為肺癌風(fēng)險篩查和干預(yù)提供了潛在候選生物標(biāo)志物。
“在全基因組相互作用篩查仍是個挑戰(zhàn)的今天，大多數(shù)全基因組關(guān)聯(lián)研究（GWAS）都為主要起效的相關(guān)基因而設(shè)計，很少有做互作分析的，”項目領(lǐng)導(dǎo)者Yafang Li博士說。“這項研究是迄今為止最大規(guī)模的肺癌全基因組SNP與吸煙行為的相互作用分析報告。我們在分析中采取了兩步驟策略以減少普通基因與環(huán)境相互作用分析的功率損耗。”
“首先，我們進(jìn)行了13336例NSCLC病例相互作用分析來評估SNPs與吸煙行為，p值小于0.001的候選SNPs被進(jìn)一步與13970名對照比對，進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)病例與對照相互作用分析。”
“利用包括5377個對照和3054個NSCLC病例的獨立復(fù)制數(shù)據(jù)集，進(jìn)一步驗證p值小于3.5x10–5的明顯SNPs。通過組織學(xué)亞型分層分析，我們最終確定了rs6441286和rs17723637是兩個肺癌高風(fēng)險SNPs。此外，吸煙和rs4751674的互動表明，后者是肺鱗癌的高風(fēng)險SNPs。”
盡管，這一報道研究使用的數(shù)據(jù)僅限為高加索人群，但研究人員表示將使用其他人類種群基因型確定行為與基因型之間的相互作用。
原文標(biāo)題
Genome-wide interaction study of smoking behavior and non-small cell lung cancer risk in Caucasian population
來源：生物通
