發(fā)布日期:2017-11-03
大多數(shù)婦女在診斷出卵巢癌時(shí)已是疾病晚期,只有四分之一的患者可存活五年以上。不過(guò),若能早期發(fā)現(xiàn),卵巢癌患者的5年生存率可從20-30%提高到60-70%。
目前的早期檢測(cè)手段(如超聲檢測(cè)或CA125檢測(cè))假陽(yáng)性較高。臨床試驗(yàn)表明,利用這些手段檢測(cè)早期卵巢癌時(shí),對(duì)生存率沒有明顯影響。于是,Dana-Farber癌癥研究所和布列根婦女醫(yī)院的研究團(tuán)隊(duì)希望找到一種更敏感、更特異的檢測(cè)工具。
研究人員將目光投向了基因組中的非編碼區(qū)域——microRNA(miRNA)。布列根婦女醫(yī)院的Kevin Elias博士將其稱之為基因組的文案編輯者,“在基因轉(zhuǎn)錄翻譯成蛋白質(zhì)之前,miRNA修改信息,在基因組中添加校對(duì)筆記。”Elias是這篇論文的第一作者。
在這項(xiàng)研究中,Elias及其同事發(fā)現(xiàn)卵巢癌細(xì)胞和正常細(xì)胞有著不同的miRNA表達(dá)譜。同時(shí),miRNA在血液中循環(huán),這樣就能利用血清樣本來(lái)檢測(cè)。研究人員對(duì)135名婦女(手術(shù)或化療前)血液樣本中的miRNA進(jìn)行測(cè)序,創(chuàng)建出一個(gè)“訓(xùn)練樣本集”。他們借此對(duì)計(jì)算機(jī)程序進(jìn)行訓(xùn)練,以找出卵巢癌、良性瘤和健康組織之間的miRNA差異。
憑借這種機(jī)器學(xué)習(xí)方法,研究人員可以利用大量的miRNA數(shù)據(jù),并開發(fā)出不同的預(yù)測(cè)模型。準(zhǔn)確區(qū)分卵巢癌和良性組織的模型被稱為神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型,它反映了miRNA之間復(fù)雜的相互作用。
然后,團(tuán)隊(duì)在44名婦女中測(cè)試了這個(gè)模型,以確定檢測(cè)的準(zhǔn)確性。在準(zhǔn)確性得到確認(rèn)之后,他們又利用859個(gè)患者樣本來(lái)測(cè)定此模型的敏感性和特異性。結(jié)果表明,這種新技術(shù)在卵巢癌預(yù)測(cè)上比超聲檢查要好得多。利用超聲檢測(cè)時(shí),只有不到5%的異常結(jié)果是卵巢癌,而利用miRNA檢測(cè)時(shí),幾乎100%的異常結(jié)果代表了卵巢癌。
最后,研究人員將這個(gè)模型應(yīng)用到實(shí)踐中。他們利用miRNA檢測(cè)來(lái)預(yù)測(cè)波蘭的51名外科手術(shù)患者的診斷結(jié)果。在這個(gè)群體中,91.3%的異常檢測(cè)結(jié)果是卵巢癌,意味著假陽(yáng)性率很低。陰性檢測(cè)結(jié)果則在80%的情況下可靠預(yù)測(cè)癌癥不存在,這與巴氏涂片的準(zhǔn)確性相當(dāng)。
“關(guān)鍵在于,這種檢測(cè)不大可能誤診卵巢癌,在沒有惡性腫瘤的情況下,它不會(huì)給出陽(yáng)性信號(hào)。這是診斷檢測(cè)是否有效的標(biāo)志,”通訊作者、Dana-Farber癌癥研究所的Dipanjan Chowdhury如是說(shuō)。
為了讓這種診斷工具進(jìn)入臨床,研究人員需要驗(yàn)證,隨著時(shí)間推移卵巢癌風(fēng)險(xiǎn)增加時(shí),miRNA的特征將如何改變。為了實(shí)現(xiàn)這一點(diǎn),他們需要不斷收集縱向樣本。他們還有興趣了解這種工具是否對(duì)高危婦女和一般人群都有用。
原文標(biāo)題
Diagnostic potential for a serum miRNA neural network for detection of ovarian cancer
來(lái)源:生物通