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    斯坦福大學(xué)邢磊主任:深度學(xué)習(xí)在放療中的應(yīng)用

       日期:2017-10-31     瀏覽:260    
    核心提示:發(fā)布日期:2017-10-31 作為醫(yī)學(xué)影像方面的技術(shù)專家和實(shí)戰(zhàn)專家,斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)物理中心主任

    發(fā)布日期:2017-10-31

    作為醫(yī)學(xué)影像方面的技術(shù)專家和實(shí)戰(zhàn)專家,斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)物理中心主任、匯醫(yī)慧影首席科學(xué)家邢磊教授近日連續(xù)受邀參加國內(nèi)外放射放療學(xué)術(shù)會議,包括2017美國醫(yī)學(xué)物理年會(AAPM), 成都圖像計(jì)算與數(shù)字醫(yī)學(xué)國際研討會, 第一界人工智能在醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用峰會, 美國放射腫瘤學(xué)會(ASTRO)年會, 以及由北京醫(yī)師協(xié)會放射??漆t(yī)師分會等。近年來AI技術(shù)被廣泛討論。 如何將AI融合臨床,如何幫助影像醫(yī)生釋放更多價值,如何從影像診斷為切入點(diǎn),用AI來深入腫瘤治療全鏈條,也是當(dāng)前熱門話題,這是一場數(shù)據(jù)和算法的博弈,更是診斷與治療的彼此協(xié)同。

    斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)物理系主任、斯坦福大學(xué)杰出教授邢磊博士攜匯醫(yī)慧影人工智能分析云平臺(英文版)亮相各峰會。 邢教授的主題為《AI在臨床診療中的應(yīng)用》的精彩分享博得了廣大與會者的一致贊同。邢磊教授是美國斯坦福大學(xué)終身教授、 同時兼任斯坦福電子工程系、分子影像及生物信息專業(yè)以及Bio-X的教授。他從事醫(yī)學(xué)影像,醫(yī)學(xué)物理以及醫(yī)學(xué)信息方面的教學(xué)研究長達(dá)20余年,發(fā)表了300余篇專業(yè)論文,并主持過多個NIH、DOD、NSF、ACS、RSNA等機(jī)構(gòu)的重大科研項(xiàng)目,曾獲美國癌癥協(xié)會研究學(xué)者獎、美國醫(yī)學(xué)物理學(xué)會 (AAPM) 最佳論文獎、及谷歌研究獎。邢磊博士同時還是AAPM和 AIMBIE(美國醫(yī)學(xué)與生物工程院)會士, 國家“千人計(jì)劃”專家。

    以下是邢磊博士的分享原文集萃,雷鋒網(wǎng)做了不改變原意的編輯:

    臨床痛點(diǎn)催生AI在醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用機(jī)會

    討論AI在醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用, 首先要弄清楚什么是醫(yī)學(xué)?,F(xiàn)代醫(yī)學(xué)是循證醫(yī)學(xué)(Evidence-based Medicine),主要包含三個部分:臨床經(jīng)驗(yàn)、科學(xué)數(shù)據(jù)和患者的實(shí)際狀況和意愿。

    這三點(diǎn)看著簡單,臨床實(shí)踐起來卻很困難。醫(yī)學(xué)是科學(xué)也是一門藝術(shù),涉及醫(yī)生的素質(zhì)和經(jīng)驗(yàn)積累。正因如此,臨床醫(yī)學(xué)中存在著許多問題,給AI在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用創(chuàng)造了絕佳的機(jī)會。

    首先,臨床采集到的數(shù)據(jù)常帶有一定的偏差和不確定性。用這些經(jīng)驗(yàn)數(shù)據(jù)來做臨床決策是一個十分復(fù)雜的過程。這個過程通常很難或根本無法用一般的簡單數(shù)學(xué)模型來描述。 其次, 目前放射科和放療科業(yè)務(wù)重復(fù)、勞動強(qiáng)度大。第三,建設(shè)醫(yī)學(xué)影像部門成本高昂,各大三甲醫(yī)院和市縣鄉(xiāng)級醫(yī)院之間的基礎(chǔ)設(shè)施相差懸殊。而AI技術(shù)可以隨著應(yīng)用規(guī)模擴(kuò)大,邊際成本不斷降低,擁有無可比擬的優(yōu)勢。 AI技術(shù)的應(yīng)用可以將醫(yī)生從很多繁復(fù)低效的工作中解放出來, 提高醫(yī)務(wù)工作者的平均水平和效率,使他們能夠把寶貴的時間精力花在更有價值的創(chuàng)造性的臨床工作上。 更進(jìn)一步,臨床試驗(yàn)往往耗時很長,從有結(jié)果到真正應(yīng)用于臨床,往往需要三至五年。AI技術(shù)的應(yīng)用可以加速臨床試驗(yàn)效率。可以毫不夸張地說,AI是實(shí)現(xiàn)個體化醫(yī)療的一項(xiàng)不可缺少的技術(shù)。

    在循證醫(yī)學(xué)中,臨床決定是和證據(jù)和數(shù)據(jù)緊密相連的。伴隨著科學(xué)及醫(yī)療技術(shù)的突飛猛進(jìn),數(shù)據(jù)越多, 臨床決定的維度也就越多。從認(rèn)知能力的角度來說, 一個人可以同時考慮的變量個數(shù)是很有限的。同一時間內(nèi)能自如地處理十個因素的,就可算作superman了。但現(xiàn)實(shí)中, 一個腫瘤醫(yī)生要考慮的因素往往要遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過這個維度, 其難度和不確定性可想而知。

    此外,我們正處在一個知識大爆炸的時代。每天都有關(guān)于的文章發(fā)表,而這些知識的半衰期平均只有幾年,很容易過時被人們遺忘。因此,應(yīng)用AI來快速提取數(shù)據(jù)精華用于臨床是十分重要的。

    深度學(xué)習(xí)在臨床中的應(yīng)用

    相信各位專家對計(jì)算機(jī)輔助診斷——也就是CAD,都很熟悉。早在八十年代,就有很多人在做這件事情,涌現(xiàn)了很多公司。 后來被Hologic Inc. 收購的R2 Technology是其中一家比較有名的代表。隨著計(jì)算機(jī)的計(jì)算能力增強(qiáng),以及GPU的出現(xiàn),深度學(xué)習(xí)逐漸走向大家的視線。 如今,深度學(xué)習(xí)已經(jīng)廣泛應(yīng)用到了我們的日常工作和生活中。

    機(jī)器學(xué)習(xí)的過程與兒童認(rèn)知的過程很相似: 通過大量的現(xiàn)有樣本訓(xùn)練機(jī)器,告訴它什么是貓什么是狗。學(xué)習(xí)一定數(shù)量的樣本之后,機(jī)器在其他不同場合見到小貓小狗時,就能將它們識別出來?,F(xiàn)實(shí)生活中用到這種能力的場景很多。放射科醫(yī)生根據(jù)自身經(jīng)驗(yàn),參考病人的病史和其他臨床信息做出診斷就是一個經(jīng)典的例子。

    機(jī)器學(xué)習(xí)可以分為三大類 。我們首先要用大量的數(shù)據(jù)來訓(xùn)練出模型后,才能對新的數(shù)據(jù)進(jìn)行分析判斷和預(yù)測。 近幾年,深度學(xué)習(xí)十分火熱,這可能和跟人際圍棋大戰(zhàn)有莫大的關(guān)系:)。其實(shí),機(jī)器戰(zhàn)勝人類已經(jīng)不是第一次了。早在二十年前,IBM的Deep Blue就已經(jīng)擊敗了象棋界的國際象棋棋王卡斯帕羅夫。 最近AlphaGo的兩次人機(jī)大戰(zhàn)又把人工智能推到了新的高度,因?yàn)閲逡恢北蛔u(yù)為是“人類智慧皇冠上的明珠”。

    深度學(xué)習(xí)和強(qiáng)化深度學(xué)習(xí)是目前醫(yī)學(xué)影像領(lǐng)域使用最多的技術(shù)。 它們可以用來解決很多以前無法解決的難題 。今年斯坦福計(jì)算機(jī)系的S. Thrun在Nature上發(fā)表的有關(guān)皮膚癌檢測的研究成果可以說是一個很成功的案例。他們基于近13萬例皮膚癌樣本,訓(xùn)練了一個CNN深度學(xué)習(xí)模型,然后用了約2000個樣本對其進(jìn)行測試。該模型的性能可與經(jīng)驗(yàn)豐富的皮膚科醫(yī)生媲美。

    在充分挖掘人工智能的潛力, 打造一個全球化的智能醫(yī)療影像平臺方面,匯醫(yī)慧影一直走在行業(yè)的最前沿。匯醫(yī)慧影正在利用深度學(xué)習(xí)來模擬人腦對三維圖像的認(rèn)識過程,并取得了驚人的進(jìn)展。人腦會從顏色、形狀、抽象識別等五個維度對圖像進(jìn)行處理。因此不同區(qū)域模擬認(rèn)知過程的算法不盡相同。他們在實(shí)踐中積累了大量的經(jīng)驗(yàn),在配齊大量的臨床數(shù)據(jù)積累、提高計(jì)算效率,優(yōu)化深度學(xué)習(xí)算法,和構(gòu)建不斷自我提高的模型方面取得了優(yōu)異的進(jìn)展。

    一、AI在治療計(jì)劃中預(yù)測肝癌肺癌放療產(chǎn)生的副作用

    AI在放療中有很多應(yīng)用,比如如何預(yù)測肝癌肺癌放療可能產(chǎn)生的副作用。用深度學(xué)習(xí)模型可替代現(xiàn)有的諾模圖, 從而實(shí)現(xiàn)準(zhǔn)確度更高的個體化預(yù)測?,F(xiàn)有方法是在給出劑量分布后,通過一些指標(biāo)評估預(yù)測放療的毒性,比如平均劑量大于多少會產(chǎn)生臨床上無法接受的毒性。使用深度學(xué)習(xí)模型可以代替這些舊的指標(biāo),不再依靠僅有的幾個參數(shù)做臨床決定。

    我們用大量病人的影像、治療計(jì)劃和治療后的毒性等數(shù)據(jù),構(gòu)建了世界上第一個基于深度學(xué)習(xí)的肝癌放療模型。它可以方便準(zhǔn)確地對新病人的預(yù)后進(jìn)行預(yù)測。 和實(shí)際臨床觀測到的預(yù)后相比發(fā)現(xiàn),深度學(xué)習(xí)的預(yù)測要比現(xiàn)有模型要準(zhǔn)確得多。這可以說是深度學(xué)習(xí)在放療轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)中的首次實(shí)質(zhì)性應(yīng)用。

    二、AI在治療計(jì)劃及圖像分析重建方面的應(yīng)用

    放療過程是很個體化的,需要根據(jù)病人的解剖學(xué)特征和腫瘤位置不斷進(jìn)行優(yōu)化,這是個很復(fù)雜的過程。因此,制定治療計(jì)劃是一件非常耗時的工作。一般而言, 一個經(jīng)驗(yàn)豐富的技術(shù)人員為復(fù)雜病人制定治療計(jì)劃經(jīng)常要花費(fèi)幾小時到幾天的時間。我們科室每年大概有三千多例病人,可想而知需要耗費(fèi)多少時間和精力。 用深度學(xué)習(xí)制定治療計(jì)劃,可以大幅度地提高制定治療計(jì)劃效率和質(zhì)量。目前,我們已經(jīng)將谷歌AlphaGo的算法成功地應(yīng)用到了治療計(jì)劃的優(yōu)化中。 我們將利用該算法制定的治療計(jì)劃與人工計(jì)劃進(jìn)行比較,結(jié)果比現(xiàn)有的方法所產(chǎn)生的計(jì)劃都好, 且易于在加速器上實(shí)現(xiàn)。

    在用MRI來進(jìn)行心臟等運(yùn)動器官的成像或使用MRI引導(dǎo)放療,需要迅速實(shí)時地采集并重建MRI圖像?,F(xiàn)有的MRI每秒可生成 4-8幀平面圖像。用深度學(xué)習(xí)模型可以極大地縮短三維MRI圖像重建所需的時間, 使“實(shí)時”的四維MRI圖像重建成為可能。機(jī)器學(xué)習(xí)也同樣可以應(yīng)用于CT圖像的重建。在CT成像時, 病人通常要接受1-5 cGy的輻射劑量,如果劑量降低,噪聲信號就會顯著升高,導(dǎo)致圖像質(zhì)量下降。我們用以前病人的CT數(shù)據(jù)構(gòu)建一個模型,利用該模型與新的低劑量數(shù)據(jù)聯(lián)合進(jìn)行重建。從而將大大地降低了CT成像的輻射劑量。

    三、AI及影響組學(xué)在圖像分析及臨床中的應(yīng)用

    深度學(xué)習(xí)在疾病篩查檢測方面的應(yīng)用研究也很活躍,新方法新技術(shù)層出不窮。 比如,我們實(shí)驗(yàn)室正在用深度學(xué)習(xí)來改進(jìn)現(xiàn)有的前列腺癌的檢測方法。大致地講,當(dāng)發(fā)現(xiàn)前列腺特異性抗原(PSA)升高時,一般要靠MRI及活檢來確診。 我們通過大量的病人影像及診斷結(jié)果,利用深度學(xué)習(xí)來進(jìn)行前列腺腫瘤的診斷分析,由此找出所有病灶及腫瘤的惡化程度,從而避免或減少活檢及病人的花費(fèi)和痛苦。

    相信各位對放射組學(xué)都熟悉。說到放射組學(xué),順便向大家介紹一本書,題目是“Radiomics and Radiogenomics”,是由我和斯坦福的三位同事一同編寫的,將于明年初夏出版。利用放射組學(xué),可以對特征值進(jìn)行篩選。 我們最近在Radiology上發(fā)表了用放射組學(xué)研究膠質(zhì)瘤預(yù)后的文章。另外, 膠質(zhì)瘤的治療中,一個很重要的臨床問題就是如何區(qū)分假進(jìn)展和真進(jìn)展。治療后病人的定期復(fù)查中,對上述兩種情況的治療決定是完全不同的——前者要停藥,后者要繼續(xù)治療。利用神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),應(yīng)該可以很好地解決這一問題。

    AI在臨床應(yīng)用中遇到的挑戰(zhàn)-算法,數(shù)據(jù),和數(shù)據(jù)交換方式

    到目前為止,計(jì)算機(jī)視覺的研究應(yīng)用主要是在二維空間里進(jìn)行的。而醫(yī)學(xué)影像幾乎全是三維甚至四維的,比如CT、MRI、PET等。真正意義上的醫(yī)學(xué)影像學(xué)習(xí)和處理實(shí)際才剛剛起步。 除了算法,AI應(yīng)用于醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的另一關(guān)鍵是數(shù)據(jù)和如何有效地進(jìn)行數(shù)據(jù)交換。深度學(xué)習(xí)需要不斷地改進(jìn)模型,因此需要海量數(shù)據(jù)。 匯醫(yī)慧影平臺可以將數(shù)據(jù)以大家所認(rèn)同的格式存放在云端,供多個專家共享 -這對大數(shù)據(jù)處理和深度學(xué)習(xí)是至關(guān)重要的。除了影像和電子病歷(EMR)數(shù)據(jù),今后我們還希望能將病人的基因組學(xué)數(shù)據(jù)、可穿戴數(shù)據(jù)等也融入進(jìn)去,從而更加方便地進(jìn)行多方位深度學(xué)習(xí)。數(shù)據(jù)共享實(shí)際上是一個大問題,涉及技術(shù)、管理,社會等各個方面。有篇發(fā)表在Lancet Oncology上的文章曾對此做了深入的探討, 里面提到的數(shù)據(jù)共享的障礙在中國也普遍存在。 我相信,伴隨著大量的高質(zhì)量數(shù)據(jù)涌出,未來AI在臨床應(yīng)用的前景是非常樂觀的。

    最后總結(jié)歸納一下,今天我主要舉例討論了深度學(xué)習(xí)在診斷、圖像重建、放療決策等方面的應(yīng)用。目前,人工智能在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用才剛剛開始, 真正實(shí)現(xiàn)臨床醫(yī)學(xué)上的實(shí)質(zhì)性應(yīng)用估計(jì)還需要三至五年。未來還有很長的路要走。至于AI將來能否取代醫(yī)生這個“永恒的話題”, 我們以后換個比較輕松的環(huán)境再討論吧:)

    來源:AI掘金志(微信號 HealthAI)

     
     
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