發(fā)布日期：2017-08-25
新聞事件
今天這一期的《自然》雜志發(fā)表一篇題為“check your chemistry”的文章，反映現(xiàn)在藥物研究中使用的化學(xué)工具質(zhì)量參次不齊。從純度不夠到結(jié)構(gòu)錯誤，列舉多個例子，包括前幾年輝瑞bosutinib那個烏龍。最近的例子包括SCR7化學(xué)結(jié)構(gòu)錯誤，鋅離子、甲基吡咯酮等常見雜質(zhì)對assay的干擾等。Scripps的Kim Janda說“if you don’t pay attention to the chemistry, the chemistry will bit you in the ass”。
藥源解析
化學(xué)工具是藥物研究不可缺少的工具，但是很多實驗室沒有條件自己合成工具化合物，所以只能依賴從商家購買。但現(xiàn)在的商家水平參差不齊，除了個別時候結(jié)構(gòu)徹底弄錯，樣品純度不夠是常見現(xiàn)象。尤其是一些靠低價競爭的商家，質(zhì)量難以保證，正如文章所說“cheap can be very expensive”。即使商家賣的化合物沒問題，有些化合物不穩(wěn)定儲存時間長了也會降解或發(fā)生其它反應(yīng)。
所以無論哪來的工具化合物都應(yīng)該先確定結(jié)構(gòu)正確、純度足夠?，F(xiàn)在LCMS和NMR都可以以較大通量鑒定樣品結(jié)構(gòu)和純度，成本也很低。對于手性化合物要用手性色譜柱、旋光、VCD、X-ray等技術(shù)鑒定絕對構(gòu)型和手性純度。制藥公司在HTS后對大量苗頭化合物都要進(jìn)行純度和結(jié)構(gòu)鑒定，這是hit-to-lead的工作之一。但學(xué)校里這方面的資源稍差，有些生物學(xué)家可能也過分相信化學(xué)的可靠性。
化學(xué)生物學(xué)是使用化學(xué)工具研究生物體系，如果結(jié)構(gòu)錯誤或雜質(zhì)干擾目標(biāo)蛋白的活性，那么顯然結(jié)果不會可靠。著名的反應(yīng)停就是一個消旋混合物，其中R構(gòu)型有安定療效、而S構(gòu)型則有致畸副作用。當(dāng)然雜質(zhì)也有立功的時候，例如抗過敏藥物色甘酸鈉就是合成目標(biāo)化合物中的一個雜質(zhì)。純化之后療效消失了，后來回去分析那批有療效的樣品才發(fā)現(xiàn)里面含有少量色甘酸鈉。
純度和結(jié)構(gòu)錯誤相對容易發(fā)現(xiàn)，也容易改正?；瘜W(xué)工具更大的問題是化合物本身性質(zhì)未知太多、或根本就不是合格的工具化合物。一個理想的工具化合物應(yīng)該與目標(biāo)蛋白高強度結(jié)合而與其它蛋白無相互作用，但實踐中這很難做到。一是這樣高選擇性本身就很困難，比如現(xiàn)在的激酶工具化合物基本100%不合格。二是全面測量選擇性十分昂貴，要100%準(zhǔn)確得幾萬個蛋白一一排除，實際工作中只能選取代表性蛋白。當(dāng)然工具化合物還要有足夠穩(wěn)定性、水溶解度等其它性質(zhì)。如果作為in vivo 工具化合物那么還要PK較好，這通常需要大量優(yōu)化工作。所以雖然純度和結(jié)構(gòu)也是問題，但還算不上主要問題。
來源：美中藥源（微信號：meizhongyaoyuan）
