發(fā)布日期：2017-08-17
能夠預(yù)測腫瘤細胞對藥物的耐藥性或敏感性是癌癥精確治療的關(guān)鍵成功因素。但是，這樣的預(yù)測是很難做到的，因為腫瘤的基因改變隨著時間的推移而動態(tài)變化，而且通常是相互依賴的，這是一種缺乏了解的模式。 瑞士洛桑大學(xué)生物信息學(xué)研究所最近的一項研究為預(yù)測癌癥的耐藥性提供了一個很有前景的框架，他們預(yù)測了大約500種已知腫瘤改變，以及它們對超過200種常見癌癥藥物的反應(yīng)。發(fā)表在《癌癥細胞》上的研究表明，雖然基因改造的某些共同作用會使腫瘤細胞對特定藥物產(chǎn)生耐藥性，但也會使它們對其他意想不到的藥物敏感。 癌癥是一種不斷變化的疾病，它通過出現(xiàn)和選擇新的基因改變而進化。為了將特定的藥物與這種改變相匹配，并預(yù)測它們的反應(yīng)，就需要了解變化是如何相互依存，并在腫瘤中共同發(fā)生的。 研究人員表示：“如果你把基因改造視為食品，那么癌細胞就不是一堆被困在冰箱里的產(chǎn)品，而是精心設(shè)計的晚餐菜單，在這些菜單中，菜肴的組合和味道都是匹配的。” 在此次研究中，研究人員能夠研究腫瘤的變化是如何相互依賴的，以及這些依賴性如何決定癌癥的進化。他們提供了一份關(guān)于500個已知腫瘤改變和一個強有力的理論框架的相關(guān)性圖，以預(yù)測這種改變的共同發(fā)生，以及他們對超過200種常見癌癥藥物的預(yù)期反應(yīng)。 研究小組發(fā)現(xiàn)，基因組改變的某些依賴性可能會使腫瘤細胞對特定藥物產(chǎn)生耐藥性，而同時也是“阿喀琉斯之踵”，讓它們對其他意想不到的藥物過敏。例如，通過分析1000個細胞株的數(shù)據(jù)，研究小組可以預(yù)測，當(dāng)基因突變和RNF43的突變發(fā)生時，細胞對vx - 680(一種抑制細胞增殖的極光激酶的藥物)變得敏感。 因此，作者提出了一種新的關(guān)于癌癥進化的思考方式：“與疾病相關(guān)的基因改變并不是隨機選擇的，而是完全基于它們的單一效應(yīng)，但結(jié)合進化來最大化它們的協(xié)同作用。”為了證明他們的發(fā)現(xiàn)，研究小組使用了來自癌癥基因組圖譜的最全面分子數(shù)據(jù)集，其中包括來自23種腫瘤類型的6，456個人類腫瘤樣本。這類癌基因依賴性圖譜是改善個性化治療方法設(shè)計的關(guān)鍵第一步，可以作為功能和臨床前研究的參考。
來源：sciencedaily
