發(fā)布日期:2017-08-16
IBM與紐約基因組研究中心(NYGC)針對(duì)數(shù)十個(gè)腦部癌癥患者的基因組學(xué)進(jìn)行了研究,報(bào)告顯示IBM Watson僅用10分鐘時(shí)間就完成對(duì)腦癌患者基因組的分析,但人類專家需要用160個(gè)小時(shí)來(lái)完成同樣的工作。但I(xiàn)BM Watson提出的治療方案并沒(méi)有人類專家的方案精確周到。
本文主要分析研究中解決的兩個(gè)問(wèn)題:1)是否掃描整個(gè)基因組比只進(jìn)行“基因面板”測(cè)試得到的信息更全面;2)將IBM Waston和NYGC專家團(tuán)隊(duì)所做的基因組分析進(jìn)行比較。
本文來(lái)源于spectrum.ieee.org,作者Eliza Strickland;由億歐編譯。
在治療腦部癌癥的時(shí)候,時(shí)間是至關(guān)重要的。
IBM與紐約基因組研究中心(NYGC)針對(duì)數(shù)十個(gè)腦部癌癥患者的基因組學(xué)進(jìn)行了研究,該研究報(bào)告顯示IBM Watson僅用10分鐘時(shí)間就完成對(duì)腦癌患者基因組的分析,并提出了一項(xiàng)治療計(jì)劃,這展示了人工智能在改善病人護(hù)理方面的潛力。然而,人類專家需要耗費(fèi)160個(gè)小時(shí)做出類似的計(jì)劃。雖然Waston在時(shí)間方面領(lǐng)先,但其治療意見和效果可能并不是最佳的,因此這并不意味著機(jī)器將完全戰(zhàn)勝人類。
該研究基于以下案例。一名患有頭痛和行動(dòng)困難癥狀的76歲男子去醫(yī)院檢查,腦部掃描顯示為惡性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤,于是醫(yī)生快速實(shí)施治療計(jì)劃。IBM Waston和醫(yī)生都對(duì)該男子的基因組進(jìn)行了分析,并分別提出了一項(xiàng)治療方案,但不幸的是,該男子病情惡化太快,不久后便去世了。
IBM不斷致力于優(yōu)化其認(rèn)知技術(shù)平臺(tái)Waston,以應(yīng)對(duì)醫(yī)療方面的多重挑戰(zhàn),包括加快藥物研發(fā)速度,以及提高患者護(hù)理方法,其特點(diǎn)是其自然語(yǔ)言處理能力。因此,在基因組學(xué)方面,Waston可以自行查閱來(lái)自醫(yī)療文獻(xiàn)及其他來(lái)源的2300萬(wàn)篇期刊文獻(xiàn),并進(jìn)行消化理解。Watson基因組學(xué)科研團(tuán)隊(duì)的負(fù)責(zé)人Laxmi Parida表示,大多數(shù)癌癥患者在檢查基因突變時(shí),并沒(méi)有掃描體內(nèi)的整個(gè)基因組(包括30億個(gè)DNA單位),而是只進(jìn)行“基因面板”測(cè)試,即只檢查那些在已知癌癥中起作用的基因子集。相對(duì)于全基因組檢測(cè),“基因面板”測(cè)試快速,但結(jié)果可能并不全面。
這項(xiàng)新研究發(fā)表在《神經(jīng)遺傳學(xué)》雜志上,并引用上述76歲患者的案例來(lái)闡述以下兩個(gè)問(wèn)題。
首先,研究人員想知道是否掃描整個(gè)基因組比只進(jìn)行“基因面板”測(cè)試得到的信息更全面呢?Parida說(shuō):“我們?cè)噲D解答這個(gè)問(wèn)題,是否全基因組檢測(cè)會(huì)得到更多有用的信息?”這個(gè)問(wèn)題的答案是肯定的。NYGC的臨床醫(yī)生和Waston發(fā)現(xiàn),那些不在“基因面板”測(cè)試范圍內(nèi)的基因突變有助于為找到潛在藥物和臨床試驗(yàn)提供建議。
其次,研究人員希望將IBM Waston和NYGC專家團(tuán)隊(duì)所做的基因組分析進(jìn)行比較。Waston和NYGC專家團(tuán)隊(duì)都獲得了病人的基因組信息,并識(shí)別出了突變的基因,然后通過(guò)醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)來(lái)檢查這些突變是否在其他癌癥中有所出現(xiàn),繼而尋找治療成功的相關(guān)報(bào)告,最終檢查患者是否具備臨床試驗(yàn)的條件。專家團(tuán)隊(duì)花費(fèi)160個(gè)小時(shí)來(lái)完成這一系列操作,而Waston則在10分鐘內(nèi)完成。
盡管Waston率先提出解決方案,但其方案可能不是最好的。NYGC的臨床醫(yī)生發(fā)現(xiàn)了兩種基因突變,綜合考慮來(lái)看,醫(yī)生建議患者參與臨床試驗(yàn)。如果患者具備參與臨床試驗(yàn)的條件,他就會(huì)被納入這個(gè)實(shí)驗(yàn),作為其生存的最佳機(jī)會(huì)。但Waston并沒(méi)有綜合考慮這些信息,因此Waston沒(méi)有建議患者進(jìn)行臨床試驗(yàn)。
雖然人們很容易把這項(xiàng)研究看作是人類和人工智能之間的競(jìng)爭(zhēng),但NYGC的負(fù)責(zé)人兼首席研究員Robert Darnell并不這樣認(rèn)為,他表示:“NYGC提供了腫瘤學(xué)家和生物學(xué)家的臨床輸入,但Waston提供的注釋使分析更加快速。”
Robert Darnell表示,醫(yī)生需要像Waston這樣的人工智能工具,才能跟上醫(yī)療數(shù)據(jù)的迅猛增長(zhǎng)。IBM的Parida指出,近年來(lái),全基因組測(cè)序成本直線下降,這使得全基因組測(cè)序?qū)⒑芸斐蔀榘┌Y治療的常規(guī)部分。如果IBM Watson或類似的人工智能系統(tǒng)能夠迅速獲得這些數(shù)據(jù),那么他們就有機(jī)會(huì)及時(shí)提供治療建議,以挽救類似腦癌患者的生命。
Darnell表示,他希望IBM Waston將成為癌癥治療的一個(gè)常規(guī)部分,因?yàn)榕R床醫(yī)生需要處理的數(shù)據(jù)實(shí)在是太龐大了。他說(shuō):“我認(rèn)為,讓醫(yī)生投入更多的精力來(lái)處理雪崩一樣的數(shù)據(jù)不是很好的選擇。時(shí)間對(duì)患者來(lái)說(shuō)是非常重要的一個(gè)因素,機(jī)器學(xué)習(xí)和自然語(yǔ)言處理工具或許能夠提供更多有價(jià)值的東西。”
原文檢索
《IBM Watson Makes a Treatment Plan for Brain-Cancer Patient in 10 Minutes; Doctors Take 160 Hours》
來(lái)源:億歐網(wǎng)