發(fā)布日期:2017-07-17
在對(duì)瘧原蟲(chóng)基因功能的首個(gè)有史以來(lái)大規(guī)模的研究中,來(lái)自英國(guó)韋爾科姆基金會(huì)桑格研究所等研究機(jī)構(gòu)的研究人員發(fā)現(xiàn)瘧原蟲(chóng)的成功歸結(jié)于將它的基因組縮小到僅由必需基因組成。他們分析了這種瘧原蟲(chóng)基因組中的一半以上的基因,結(jié)果發(fā)現(xiàn)三分之二的這些基因是它的存活所必不可少的。這也是迄今為止在研究過(guò)的任何一種有機(jī)體中發(fā)現(xiàn)的最大比例的必需基因。這些結(jié)果鑒定出很多潛在靶標(biāo)可用于新的抗瘧疾藥物開(kāi)發(fā)。對(duì)于這種很少理解的存在嚴(yán)重耐藥性問(wèn)題的瘧原蟲(chóng)而言,這是一項(xiàng)重大的發(fā)現(xiàn)。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在2017年7月13日的Cell期刊上,論文標(biāo)題為“Functional Profiling of a Plasmodium Genome Reveals an Abundance of Essential Genes”。
瘧原蟲(chóng)的基因功能是很難理解的。它是古老的有機(jī)體,而且它的大約一半的基因在任何其他的有機(jī)體中沒(méi)有同源基因,這就使得科學(xué)家們很難發(fā)現(xiàn)關(guān)于它們的功能的線索。這項(xiàng)研究是迄今為止首次提供證據(jù)證實(shí)了大多數(shù)的這些基因的功能。
科學(xué)家們已研究了一種被稱作伯氏瘧原蟲(chóng)(Plasmodium berghei)的瘧原蟲(chóng)的基因,這些基因在它的復(fù)雜的多階段生命周期的單個(gè)血液階段中表達(dá)。在這項(xiàng)新的研究中,這些研究人員設(shè)計(jì)出一種新的方法來(lái)破譯這種瘧原蟲(chóng)的基因功能。他們敲除了2578個(gè)基因(占這種瘧原蟲(chóng)基因組的一半以上),然后給每種基因敲除設(shè)計(jì)一個(gè)獨(dú)特的DNA條形碼。
這些研究人員隨后利用下一代基因組測(cè)序技術(shù)對(duì)這些條形碼進(jìn)行計(jì)數(shù),因而測(cè)量了每個(gè)基因修飾的瘧原蟲(chóng)蟲(chóng)株的生長(zhǎng)。如果被敲除的基因不是必需的,那么這種瘧原蟲(chóng)數(shù)量激增,但是如果被敲除的基因是必需的,那么這種瘧原蟲(chóng)就會(huì)消失。
這些研究人員系統(tǒng)性地證實(shí)這種瘧原蟲(chóng)能夠很容易地清除所編碼的蛋白會(huì)讓宿主免疫系統(tǒng)知道它的存在的基因。這就給開(kāi)發(fā)瘧疾疫苗帶來(lái)問(wèn)題,這是因?yàn)檫@種瘧原蟲(chóng)能夠很快地改變它的外觀來(lái)逃避人免疫系統(tǒng)的檢測(cè),也因此它能夠?qū)Ο懠惨呙绠a(chǎn)生抵抗性。
這項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn)了更多獨(dú)特的瘧疾藥物靶標(biāo)。最高目標(biāo)就是發(fā)現(xiàn)在這種瘧原蟲(chóng)生命周期的所有階段都是必需的基因。如果人們能夠利用藥物靶向這些基因,那么就會(huì)讓瘧原蟲(chóng)無(wú)處可逃。
來(lái)源:生物谷