發(fā)布日期：2017-06-20
今天，一篇從基因?qū)用娼沂玖四c道微生物和衰老的研究發(fā)表在了《細(xì)胞》雜志上！
來自貝勒醫(yī)學(xué)院的華人科學(xué)家王萌教授帶領(lǐng)團隊以秀麗隱桿線蟲為模型，對其體內(nèi)將近4000種存在不同突變的大腸桿菌進(jìn)行了篩選，找到了幾十個能夠延長壽命、延緩腫瘤發(fā)展和β-淀粉樣蛋白積聚的基因！而且還發(fā)現(xiàn)了一個可以“續(xù)命”的化合物——莢膜異多糖酸（colanic acid，CA）[1]！
王萌教授
近年來，越來越多的研究證明，腸道微生物的變化與宿主的衰老過程有關(guān)，然而研究大多局限于群體研究和宏基因組分析，對單一微生物的基因功能及分子機制的探索還比較缺乏。
在這樣的背景下來看，這個研究的意義無疑是非常重大的。它將腸道微生物—基因—衰老—年齡相關(guān)的疾病串聯(lián)在了一起，而且鑒定出了特定的發(fā)揮作用的化合物，為研究的實際應(yīng)用提供了新的思路，可以說是“開啟了腸道微生物抵御衰老、延年益壽的大門”。
不但如此，在發(fā)現(xiàn)CA的同時，他們還揭示出了CA是通過線粒體來延緩衰老的。線粒體作為細(xì)胞中的“能量工廠”，與衰老之間的關(guān)系已經(jīng)有一些發(fā)現(xiàn)了。但是這個研究是首次證明腸道微生物竟然還可以通過代謝物與線粒體“溝通”。看來腸道微生物不僅能和遠(yuǎn)端的器官溝通，連細(xì)胞器都可以，可真的算是“無孔不入”了！
線粒體
為什么研究中使用的偏偏是大腸桿菌呢？因為秀麗隱桿線蟲以大腸桿菌等細(xì)菌為食，在實驗室培養(yǎng)時，通常會在培養(yǎng)基上養(yǎng)出大腸桿菌菌落，再讓線蟲的幼蟲在其中生活。這樣大腸桿菌就會在線蟲幼蟲腸腔內(nèi)定殖，隨著線蟲長大，組成線蟲的腸道菌群[2]。
在這次的研究中，為了全面的、深入的了解大腸桿菌基因?qū)用鎸勖挠绊?，研究人員建立了一個大腸桿菌單基因敲除庫，其中共包括3983種單基因突變菌株。他們單獨將每一種菌株喂給線蟲，觀察它們的壽命，經(jīng)過試驗，研究人員發(fā)現(xiàn)有29種突變菌可以將線蟲的壽命延長10%以上，其中效果最為顯著的當(dāng)屬hns突變，這組線蟲的壽命延長了40%之多！
29種可以延長線蟲壽命的突變（第一個就是hns突變）
此外，研究人員嘗試將突變引入了野生型大腸桿菌（MG1655），發(fā)現(xiàn)其中有23種依然有效。而且，即使是跨過幼蟲期，從成蟲開始喂食突變菌，仍有21種菌保持了它們對壽命的延長能力。
這讓研究人員堅定了一個想法，腸道微生物對宿主壽命的調(diào)控作用毋庸置疑，而且這些調(diào)控與特定的微生物菌株和宿主的發(fā)育階段無關(guān)。這意味著凡是存在這些突變的微生物，無論它們發(fā)生在哪個發(fā)育階段，對壽命的延長都是能夠起作用的。
當(dāng)然，如果有研究人員想通過基因工程“制造”益生菌幫助我們延長壽命，在這個研究的基礎(chǔ)上看來似乎也是可行的！“長壽村的秘密”再也不是秘密了。想象一下，將來我們要是能喝個益生菌酸奶什么的來延年益壽，豈不是美滋滋？
當(dāng)然，活得更長不是終極目標(biāo)，健康的活得更長才是。如果疾病纏身，那長壽也著實沒什么意思，所以研究人員還對突變菌能不能應(yīng)對衰老帶來的疾病進(jìn)行了驗證。
研究人員讓線蟲表達(dá)人的β-淀粉樣蛋白和生殖細(xì)胞過度增殖導(dǎo)致的腫瘤，他們分別發(fā)現(xiàn)了16個增加腫瘤線蟲存活率的突變、14個延長“癡呆”線蟲壽命的突變和12個延緩“癡呆”線蟲失去運動能力的突變。其中共有13個重合的突變出現(xiàn)，對兩種線蟲都起到了“保護(hù)作用”，這從某種意義上說明了，這13種突變可以幫助改善宿主整體的“生存質(zhì)量”。
兩組線蟲突變菌的重合情況
那么如果開腦洞的話，說不定我們前面構(gòu)想的益生菌酸奶或許也可以幫助一些患病的老年人？
在過去許多年的研究中，科學(xué)家們已經(jīng)揭示了幾種和長壽有關(guān)的分子或是信號通路機制，包括胰島素/胰島素樣生長因子1（IGF-1）、雷帕霉素靶蛋白（TOR）信號通路和熱量限制（caloric restriction，CR）。在這次的研究中，研究人員也發(fā)現(xiàn)，大部分突變菌都是通過IGF-1和TOR信號通路來延長線蟲壽命的，只有4個突變菌是通過熱量限制。
然而這些結(jié)果中不包括兩種突變菌，其中一個就是最大限度延長了線蟲壽命的hns突變，另一個是lon突變，它能將線蟲的壽命延長25%。這兩種突變并不是通過以上三條已知途徑來發(fā)揮作用的，這讓研究人員感到非常好奇，如果能發(fā)現(xiàn)這個“神秘途徑”，是不是就意味著在長壽的“通關(guān)秘籍”中，我們又能獲得一條有效提示了？
運動的線蟲
在研究人員苦無頭緒時，他們忽然發(fā)現(xiàn)這兩個基因之間還有點“不尋常”的聯(lián)系——它們共同參與一種代謝物的合成！這個代謝物就是莢膜異多糖酸（colanic acid，CA）。于是研究人員大膽猜想，會不會它們就是通過CA這個分子來提延長線蟲壽命的呢？
有了大膽的猜想，就需要小心的求證，他們首先檢測了培養(yǎng)基中CA的含量，發(fā)現(xiàn)果然都很高，而且hns和lon培養(yǎng)基中比其他的更高。除了延長壽命外，這些含有大量CA的突變菌還減弱了線蟲與衰老有關(guān)的肌肉線粒體的分解，體壁肌肉線粒體分解、功能下降是體細(xì)胞衰老的一個顯著標(biāo)志[3]。
為了證明CA的功效，研究人員將CA直接喂給線蟲，發(fā)現(xiàn)線蟲的壽命延長了20%！對于有β-淀粉樣蛋白和生殖細(xì)胞腫瘤的線蟲來說，CA的攝入也同樣改善了它們的運動能力和生存時間。另外，在實驗中攝入了CA的果蠅也顯示出了壽命的延長。
喂食CA后線蟲壽命延長了20%（黑色為對照，橘色為CA）
那么CA是通過什么方式來延長壽命的呢？這就和我們剛剛提到的線粒體有關(guān)了。在攝入CA后，它可以調(diào)節(jié)線粒體的分裂，并且促進(jìn)線粒體未折疊蛋白反應(yīng)。線粒體是所有真核生物細(xì)胞中非常重要的一種細(xì)胞器，是細(xì)胞的“能量工廠”，為細(xì)胞供能，參與細(xì)胞生長的調(diào)控。
這一發(fā)現(xiàn)似乎在告訴我們，腸道微生物用自己的代謝物給線粒體“加油”，維持了能量工廠的“正常運轉(zhuǎn)”，這樣線粒體才能不知疲倦地為細(xì)胞活動提供能量，保持細(xì)胞的“青春”。
線粒體功能的下降或是障礙是衰老的一個標(biāo)志和推動因素，而蛋白質(zhì)未折疊就是導(dǎo)致線粒體功能障礙的原因之一。CA作為代謝物被腸道細(xì)胞吸收后，與細(xì)胞內(nèi)的線粒體“建立聯(lián)系”，幫助應(yīng)激條件下未折疊蛋白響應(yīng)，發(fā)生正確的折疊，恢復(fù)線粒體的信號傳導(dǎo)，維持了線粒體的功能和蛋白質(zhì)的穩(wěn)態(tài)，為線蟲“續(xù)命”。不僅如此，這一機制在哺乳動物的細(xì)胞中也同樣可以發(fā)生，加上前面的果蠅，研究人員據(jù)此認(rèn)為，這一機制在進(jìn)化上是十分保守的。
再繼續(xù)深挖的話，CA之所以可以幫助未折疊蛋白響應(yīng)就是通過轉(zhuǎn)錄因子ATFS-1，如過atfs-1基因發(fā)生突變，使ATFS-1失去功能，那么CA延長壽命這一點就不能實現(xiàn)了。
CA和突變菌對線蟲壽命的調(diào)控示意圖
對于這一點，王萌教授表示：“線粒體似乎是由數(shù)百萬年前進(jìn)入細(xì)胞的細(xì)菌演化而來的。我們的研究表明，幾百萬年后的今天，細(xì)菌仍然可以和我們細(xì)胞中線粒體發(fā)生‘溝通’，我們認(rèn)為這種溝通非常重要，在這里我們也首次為微生物和線粒體的通訊提供了證據(jù)。”[4]
今天的《細(xì)胞》雜志上，來自新加坡國立大學(xué)的研究人員也為此特意撰寫了評論文章[5]。他們指出，在這一系列的研究結(jié)果中，有兩項非常值得注意，一項是CA幫助應(yīng)激條件下的未折疊蛋白響應(yīng)，這說明未來，CA或許可以作為抵消腸道微生物應(yīng)激的方法，對于許多應(yīng)激產(chǎn)生的疾病或許都有好處。
另一項就是以CA為代表的分子的直接補充對人類來說也是種啟發(fā)。這就又回到了我們前面所說的益生菌酸奶了，不添加益生菌直接添加CA似乎也是不錯的選擇。
總而言之，這項研究雖然只是在線蟲體內(nèi)進(jìn)行，但是對于幫助研究人員更好地理解腸道微生物和衰老的關(guān)系來說至關(guān)重要，況且還鑒定出了關(guān)鍵的分子化合物，對于應(yīng)用領(lǐng)域一定也有不小的啟發(fā)，讓我們看到了“延年益壽”的希望所在。
參考資料
[1] http://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(17)30627-X
[2] Clark, L.C., and Hodgkin, J. (2014). Commensals, probiotics and pathogens in the Caenorhabditis elegans model. Cell. Microbiol. 16, 27–38.
[3] Regmi, S.G., Rolland, S.G., and Conradt, B. (2014). Age-dependent changes in mitochondrial morphology and volume are not predictors of lifespan. Aging (Albany NY) 6, 118-130.
[4] https://www.bcm.edu/news/molecular-and-human-genetics/gut-bacteria-slow-aging
[5] http://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(17)30641-4
來源：奇點網(wǎng)（微信號：geekheal_com）
