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    有了DNA存儲技術(shù),我們?nèi)梭w就是云硬盤

       日期:2017-04-12     瀏覽:127    
    核心提示:發(fā)布日期:2017-04-12 我們?nèi)梭w的所有信息都由DNA編碼組成。你可曾想過,DNA能夠

    發(fā)布日期:2017-04-12

    我們?nèi)梭w的所有信息都由DNA編碼組成。你可曾想過,DNA能夠像U盤一樣存儲信息?美國《科學(xué)》雜志近日發(fā)布的一項(xiàng)研究顯示,一克DNA的儲存容量相當(dāng)于約20萬臺電腦!具體容量約為200 PB(20萬兆)。這是因?yàn)镈NA具有密度大、穩(wěn)固耐用的特點(diǎn)。專家指出,當(dāng)今時代信息爆炸,只要解決了成本問題,那么DNA儲存技術(shù)的市場空間將無可限量。

    DNA存儲技術(shù):并非首創(chuàng)

    其實(shí)DNA儲存技術(shù)早已有人在做了。2012年,哈佛大學(xué)研究人員用DNA儲存了一本五萬字的圖書。歐洲生物信息研究所(European Bioinformatics Institute )也在DNA儲存了莎士比亞的十四行詩以及馬丁·路德·金的演講《我有一個夢想》的錄音帶。

    突破性進(jìn)展:存儲效率大幅提升

    盡管不是首創(chuàng),但是,這項(xiàng)DNA存儲技術(shù)目前迎來了重大突破。研究員Erlich是該研究報(bào)告的作者之一,他表示:這是因?yàn)檫\(yùn)用了一種編碼技術(shù),能讓DNA存儲效率提升60%,還能有效減小DNA存儲過程中的出錯率。他在美國哥倫比亞大學(xué)擔(dān)任計(jì)算機(jī)科學(xué)系教授,同時也是紐約基因組中心(New York Genome Center)的核心成員。

    “把數(shù)據(jù)輸入DNA只需要不到一秒鐘。DNA說白了只不過是四種核苷酸(nucleotides)排列組合的結(jié)果。我們只需要把這些核苷酸和數(shù)據(jù)一一對應(yīng)。”

    研究員Erlich說,一旦掌握了編碼方法,或者找到了符合編排或數(shù)據(jù)輸入要求的DNA,那接下來的工作就很輕松了。這是因?yàn)椋梢杂善髽I(yè)來負(fù)責(zé)DNA的實(shí)際制造過程。

    獨(dú)特魅力

    “這么做,是為了激發(fā)人們的想象力嗎?沒錯!就是想讓人們感受到科學(xué)有趣的一面!”

    DNA具有密度大、穩(wěn)定性高的優(yōu)勢,因此DNA儲存技術(shù)仍然比新興的同類技術(shù)更讓科學(xué)家著迷。研究員Kosuri說:“DNA儲存技術(shù)所涉及的難度,相當(dāng)于把單個原子放在一個物體表面。” 他指的是IBM公司,該公司曾在1989成功用35個氙原子拼出了“IBM”的字樣。

    他說:“排列原子也不是不可能的事,但必須要運(yùn)用極高的成像技術(shù),在接近于絕對零度的真空狀態(tài)下才能完成。這就涉及到核心技術(shù)了。相比之下,我們的DNA技術(shù)要比它更實(shí)用,雖然在存儲方面肯定沒有軟盤或U盤那么實(shí)用。”

    DNA還可以儲存3D影像。雖然全息存儲(holography memory)和賽道儲存(racetrack memory )技術(shù)也可以做到,但是研究員Kosuri說,DNA技術(shù)能儲存的密度比它們要高得多。

    克服技術(shù)難點(diǎn)

    但是,DNA的合成過程是非常艱辛的。研究員Kosuri表示:“難就難在,DNA合成過程中,約有5%的時間,會損失掉隨機(jī)合成的一個DNA。而且,不僅合成困難,就連讀取DNA也是一個問題。如果有一種編碼技術(shù)能夠避免這種損失,那么DNA存儲技術(shù)就會變得簡單得多,也利索得多。”

    美國《科學(xué)》雜志發(fā)布的這項(xiàng)研究,的確實(shí)現(xiàn)了這種編碼技術(shù)。研究員Kosuri表示,這項(xiàng)技術(shù)可以讓DNA合成過程中出現(xiàn)的失誤容易讓人接受。這要?dú)w功于一種特殊的編碼技術(shù),而用這項(xiàng)技術(shù)傳送數(shù)字信息,通常能夠適應(yīng)連接中斷的情況發(fā)生,比如在智能手機(jī)上播放Youtube視頻。Erlich表示,這就意味著,這種編碼技術(shù)能夠處理那些比研究中使用的DNA質(zhì)量低得多的DNA。

    研究員Kosuri沒有參與該項(xiàng)研究,但他是上述2012年哈佛大學(xué)研究報(bào)告的第一作者,如今是加利福尼亞大學(xué)洛杉磯分校(UCLA)的一名生物化學(xué)教授。

    蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院化學(xué)工程師Grass也參與了這項(xiàng)研究,他表示,研究團(tuán)隊(duì)成功地在DNA中存儲并且恢復(fù)了一個操作系統(tǒng),是個“優(yōu)雅的成就”。他還說:“我每天都在‘使用’DNA,所以我明白這項(xiàng)工程必須要萬無一失。” Erlich表示,他們是故意把那個操作系統(tǒng)放進(jìn)DNA的。”如果不把文件完美地恢復(fù),那么就可能會損毀某些內(nèi)容。但我們就是要證明我們不怕把這種可能會損毀的內(nèi)容放進(jìn)DNA。”

    Kosuri也同意這種方法十分高效:“我認(rèn)為他們采用了正確的實(shí)驗(yàn)測試算法。他們選對了算法,而且看起來很奏效。”

    成本巨大

    在化學(xué)工程師Grass看來,合成DNA的成本比編排DNA的成本還要大。他說:“雖然編排DNA的成本太高,無法實(shí)際應(yīng)用,不過現(xiàn)在有了納米微孔 (nanopore) 插入計(jì)算機(jī)進(jìn)行DNA編排的技術(shù),所以它的成本越來越小了。但是,合成DNA的成本仍然十分之高。”

    研究員Kosuri也表示:“DNA儲存技術(shù)規(guī)模化應(yīng)用的唯一阻礙就是,它的成本實(shí)在是太高了。關(guān)于編碼、編碼的工作方式以及這種編碼是否可靠等種種問題,我們的研究報(bào)告都一一解答了。但是,唯獨(dú)成本問題,是我們目前解決不了的。”

    Grass認(rèn)為,要想讓DNA能夠儲存信息長達(dá)數(shù)百年之久,就必須要采用另外一些手段把DNA固定住。他解釋道,基因物質(zhì)可以在動物骨頭和動植物化石中固定保存,但是自由DNA卻不一樣,具有不穩(wěn)定性。如果把它放在實(shí)驗(yàn)室,一年以后里面的信息就會開始損毀了。

    前景:依然明朗

    研究員Kosuri已經(jīng)不再從事DNA儲存技術(shù)研究,但是他本人對這項(xiàng)技術(shù)的發(fā)展還是持樂觀態(tài)度。他說:“上百萬倍的成本聽起來很嚇人,但是在過去的15年,我們已經(jīng)把成本縮小為原來的上百萬分之一了。現(xiàn)在,不僅僅是編排DNA,就連合成DNA的成本也已經(jīng)有所下降。”

    研究員Erlich憧憬在未來,有人可以發(fā)明一種“專門用于DNA存儲的工序,方便我們快速合成劣質(zhì)DNA”,從而減少成本。他說:“我們可以質(zhì)量參差不齊的DNA先提取出來,然后再根據(jù)編碼方式來逐步對其進(jìn)行糾正。這是我們未來的研究方向”

    目前的研究是一個良好的開端。研究員已經(jīng)在DNA存儲了許多內(nèi)容,它們能靈敏地減少存儲錯誤,其中包括:一個操作系統(tǒng)、一個電腦病毒、一張價值50美元的亞馬遜禮品購物卡、1895年于法國上映的世界上第一部電影《火車到站》(Arrival of a train at La Ciotat)、航天飛行器“先驅(qū)者”(Pionner)的一塊載有人類訊息的鍍金鋁板以及美國數(shù)學(xué)家、信息論的創(chuàng)始人克勞德·艾爾伍德·香農(nóng)(Claude Elwood Shannon)于1948年發(fā)表的一篇研究報(bào)告。

    研究員Erlich說:“有人問我,‘你怎么能夠把視頻存進(jìn)DNA呢?’ 這也是我要向我6歲小兒子解釋的問題。”

    來源:36Kr

     
     
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