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    DNA條形碼,私人訂制納米藥物

       日期:2017-03-21     瀏覽:144    
    核心提示:發(fā)布日期:2017-03-21 想象一下未來(lái)某天一個(gè)病人去醫(yī)院檢查,確診后醫(yī)生為了確定適合他

    發(fā)布日期:2017-03-21

    想象一下未來(lái)某天一個(gè)病人去醫(yī)院檢查,確診后醫(yī)生為了確定適合他/她的納米藥物,就先給他/她注射了小劑量的包含數(shù)百種納米藥物的混合液,第二天從病變區(qū)取出組織進(jìn)行檢測(cè),隨后便確定最適合的納米藥物并進(jìn)行治療……聽(tīng)上去似乎有點(diǎn)天方夜譚,但是研究人員的最新研究卻正在向著這樣的個(gè)性化治療目標(biāo)邁進(jìn),他們利用了一種叫做DNA條形碼的技術(shù)進(jìn)行納米藥物的篩選,以期實(shí)現(xiàn)個(gè)性化治療。那么DNA條形碼是什么呢?事實(shí)上,DNA條形碼就是一段核苷酸序列,可以通過(guò)PCR進(jìn)行擴(kuò)增以及基因測(cè)序的方法進(jìn)行解碼。通過(guò)使用DNA條形碼標(biāo)記納米藥物,研究人員可以找出最佳的治療藥物以及確定不同納米顆粒的分布。

    2016年底,來(lái)自以色列理工學(xué)院的Avi Schroeder教授課題組在Nature Communications 上發(fā)表了一篇有關(guān)抗腫瘤納米藥物個(gè)性化治療的研究論文,他們采用了DNA條形碼技術(shù)對(duì)包載不同抗癌藥物的脂質(zhì)體納米藥物的抗癌療效進(jìn)行了預(yù)測(cè)及驗(yàn)證[1]。

    目前臨床使用的抗癌藥物篩選主要通過(guò)取出病人腫瘤組織進(jìn)行體外培養(yǎng)或者移植到免疫缺陷小鼠身上,然后再測(cè)試藥物敏感性,但是由于腫瘤環(huán)境的復(fù)雜性,這種方法耗時(shí)久、操作復(fù)雜、準(zhǔn)確率不高。為了解決這些問(wèn)題,Schroeder等人提出了使用DNA條形碼這一技術(shù)在單細(xì)胞層面來(lái)標(biāo)記、追蹤和評(píng)估納米抗癌藥物的效果。

    圖1. DNA條形碼技術(shù)預(yù)測(cè)不同納米藥物抗癌療效流程圖。圖片來(lái)源:Nat. Commun.

    因?yàn)橹|(zhì)體納米藥物已經(jīng)在臨床使用,可以有效富集到腫瘤組織提高藥物抗癌療效,研究人員用脂質(zhì)體裝載不同抗癌藥物以及相應(yīng)的DNA條形碼(50-120對(duì)堿基對(duì)的DNA序列),形成多種100 nm納米顆粒。他們選擇了三種臨床使用的治療三陰性乳腺癌(TNBC)的藥物(阿霉素、順鉑、吉西他濱)在小鼠身上進(jìn)行了驗(yàn)證,一個(gè)藥物對(duì)應(yīng)一個(gè)條形碼,形成一個(gè)納米顆粒。通過(guò)體外細(xì)胞攝取實(shí)驗(yàn),他們發(fā)現(xiàn)這種DNA條形碼可以在單細(xì)胞水平進(jìn)行檢測(cè)和定量分析(圖2)。

    圖2. DNA條形碼可以在單細(xì)胞水平進(jìn)行檢測(cè)。圖片來(lái)源:Nat. Commun.

    隨后,為了檢測(cè)這種條形碼納米顆粒是否可以預(yù)測(cè)抗癌藥物的抗癌療效,他們將3種包載不同藥物的脂質(zhì)體及2個(gè)對(duì)照組脂質(zhì)體(一個(gè)包載咖啡因、一個(gè)不包載化合物)混合在一起,按照低于臨床給藥劑量的1/1000注射到生長(zhǎng)TNBC的小鼠體內(nèi),48小時(shí)后取出部分腫瘤組織并酶解為單細(xì)胞懸液,采用流式細(xì)胞術(shù)將死細(xì)胞、活細(xì)胞分開(kāi)收集并制成細(xì)胞裂解液,提取其中的DNA條形碼進(jìn)行擴(kuò)增并定量檢測(cè)。

    為了定義藥物的抗癌療效,他們將死細(xì)胞中含量高的藥物定義為療效好的藥物,活細(xì)胞中含量高的藥物定義為療效差的藥物,以死細(xì)胞中的某個(gè)DNA條形碼含量/活細(xì)胞中的該DNA條形碼含量定義細(xì)胞對(duì)藥物的敏感性,比值越高表明細(xì)胞對(duì)該藥敏感性越高,亦即該藥療效越好。結(jié)果發(fā)現(xiàn)吉西他濱對(duì)應(yīng)的DNA條形碼在死細(xì)胞中的含量遠(yuǎn)高于在活細(xì)胞中的含量,這意味著吉西他濱的抗癌療效最好(圖3)。那么事實(shí)上是不是這樣的呢?

    圖3. 使用條形碼納米顆粒預(yù)測(cè)多種藥物的抗癌療效。圖片來(lái)源:Nat. Commun.

    為了驗(yàn)證條形碼納米顆粒的預(yù)測(cè)結(jié)果是否準(zhǔn)確,他們進(jìn)行了小鼠治療實(shí)驗(yàn)。結(jié)果如圖4所示,吉西他濱的治療效果果然是最好的:腫瘤體積、質(zhì)量均為最小,腫瘤中細(xì)胞凋亡數(shù)量也最多。這表明DNA條形碼納米顆粒是快速預(yù)測(cè)抗癌藥物抗癌療效的有效診斷技術(shù),檢測(cè)所需時(shí)間短、操作簡(jiǎn)單、準(zhǔn)確率高。

    圖4. 不同納米藥物的抗癌療效與預(yù)測(cè)結(jié)果高度吻合。圖片來(lái)源:Nat. Commun.

    Schroeder教授認(rèn)為這種新技術(shù)不僅有助于篩選最佳抗癌藥物,還為研究腫瘤對(duì)不同藥物的耐藥性提供了新方法。同時(shí),他也說(shuō)道:“我的想法更實(shí)際:我們的研究能夠如何幫助病人呢?目前的研究結(jié)果讓我很興奮,但是我們還需要做更多工作將我們的技術(shù)發(fā)展成為公眾唾手可得的產(chǎn)品,但是我相信在不久的將來(lái)這項(xiàng)技術(shù)一定可以進(jìn)入臨床。”

    盡管如此,對(duì)于納米藥物而言,藥物的體內(nèi)篩選固然很重要,但是納米顆粒性質(zhì)的體內(nèi)篩選或許更重要,因?yàn)榧{米顆粒的性質(zhì)決定了納米藥物在各個(gè)組織器官中的富集量,這也就直接決定了藥物療效及副作用。同時(shí),納米顆粒性質(zhì)的體內(nèi)篩選更加繁瑣,因?yàn)榧{米顆粒的組成不僅涉及組成分子的種類(lèi)不同,還涉及相應(yīng)分子的分子量、親疏水鏈段比例、不同組分比例等等,數(shù)量之多,數(shù)不盡數(shù)!因此要進(jìn)行體內(nèi)篩選實(shí)在是耗時(shí)耗力耗小鼠,篩不起啊。

    為此,來(lái)自佛羅里達(dá)大學(xué)、佐治亞理工學(xué)院和麻省理工學(xué)院的研究人員采用相似的原理和方法成功解決了納米顆粒體內(nèi)篩選的問(wèn)題,實(shí)現(xiàn)了快速高通量篩選。他們的實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明利用DNA條形碼技術(shù)可以在一只小鼠體內(nèi)同時(shí)篩選30種納米顆粒,快速準(zhǔn)確地比較不同納米顆粒不同時(shí)間在不同器官中的富集量,同時(shí)實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)性很好,因此極大地節(jié)省了篩選所需資源(尤其是實(shí)驗(yàn)動(dòng)物資源),相關(guān)研究成果于今年2月發(fā)表在PNAS上,通訊作者包括大家熟知的大神Robert Langer教授[2]。

    圖5. 利用DNA條形碼高通量篩選納米顆粒的流程示意圖。圖片來(lái)源:PNAS

    毫無(wú)疑問(wèn),DNA條形碼技術(shù)將為納米藥物的發(fā)展帶來(lái)巨大的進(jìn)展,為藥物及納米顆粒的快速準(zhǔn)確篩選帶來(lái)了希望,允許研究人員在臨床給藥劑量的1/1000以下水平同時(shí)進(jìn)行多種藥物、多種性質(zhì)納米顆粒的體內(nèi)定量研究。如果再結(jié)合上微流控納米顆粒制備技術(shù),納米顆粒從制備到篩選將不再是問(wèn)題,這勢(shì)必將加速納米藥物的開(kāi)發(fā)和優(yōu)化,促進(jìn)納米藥物的臨床轉(zhuǎn)化。

    參考文獻(xiàn)

    1. Yaari Z, Da Silva D, Zinger A, et al. Theranostic barcoded nanoparticles for personalized cancer medicine. Nat. Commun., 2016, 7, 13325, DOI: 10.1038/ncomms13325

    2. Dahlman J E, Kauffman K J, Xing Y, et al. Barcoded nanoparticles for high throughput in vivo discovery of targeted therapeutics. PNAS, 2017, 114, 2060-2065, DOI: 10.1073/pnas.1620874114

    來(lái)源:X一MOL資訊(微信號(hào) X-molNews)

     
     
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